鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列及其毒力特征分析.pdf

文章编号:1000-0615(2020)09-1488-14水产学报,2020,44(9):1488−1501

JOURNALOFFISHERIESOFCHINA

DOI:10.11964/jfc.20200212147

鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列

及其毒力特征分析

111111,2*

王超杰，黎洁，王旭，王至诚，王卫民，罗毅

(1.华中农业大学水产学院，农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，湖北武汉430070；

2.农业微生物学国家重点实验室，湖北武汉430070)

摘要：皮特不动杆菌是一种新兴的鱼源致病菌，为了对该菌的致病机理进行研究并为该

菌引起的鱼类疾病防治提供技术储备，实验选取皮特不动杆菌菌株Ap-W20进行了全基

因组测序，并对其毒力特征进行了分析。结果发现，Ap-W20全基因组序列总长为4399705bp，

GC含量为38.78%，共预测到4230个编码序列(CDS)，存在4个质粒，GenBank数据库

登录号为CP027658~CP027662。ANI分析结果证实，Ap-W20属于皮特不动杆菌，且Ap-

W20与已知人源皮特不动杆菌AP_882(96.69%)和环境源皮特不动杆菌PHEA-2(96.55%)

相似度较高。Ap-W20与AP_882、PHEA-2的比较基因组学分析发现，Ap-W20中的基因

岛、前噬菌体和质粒数量最多，这很可能与它们各自的分离环境和致病力有关。通过与

毒力因子数据库(VFDB)比对，在Ap-W20全基因组中预测到286个毒力基因，主要与

黏附和抗吞噬等有关。Ap-W20中还存在Ⅰ、Ⅱ和Ⅵ型分泌系统、多套双组分调控系统

以及细菌素合成基因簇等，表明鱼源皮特不动杆菌可能存在复杂的致病机制。本研究对

鱼源皮特不动杆菌全基因组进行了毒力特征分析，为该菌引起的鱼类疾病防治奠定了基础。

关键词:皮特不动杆菌；全基因组测序；ANI分析；比较基因组学；毒力特征

中图分类号:Q785;S941.42文献标志码:A

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近年来，不动杆菌(Acinetobacter)已经成为高，也是目前研究最多的不动杆菌。近几年，

人类临床中常见的机会致病菌，可引起一系列皮特不动杆菌、医院不动杆菌等在医院临床暴

的感染，如肺部感染、菌血症、腹腔感染和外发流行的研究报道越来越多，正在成为发病率

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伤伤口感染等，是医源性重要致病菌。在不动仅次于鲍曼不动杆菌的临床感染菌株。由于

杆菌属中，乙酸钙不动杆菌(A.calcoaceticus)、医院不动杆菌多数具有广谱的耐药性和顽强的

鲍曼不动杆菌(A.baumannii)、皮特不动杆菌(A.生存能力，所以对于不动杆菌的研究多集中于

pittii)、医院不动杆菌(A.nosocomialis)、洛菲不耐药性和各种抗性表型，而对毒力的研究则相

动杆菌(A.seiferii)和约翰不动杆菌(A.