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第五章基因表达调控;RNA与转录调控
真核生物的RNA种类与不同的RNA聚合酶
活性染色质结构是基因转录的前提
转录过程与调控
起始
延伸
终止
转录后水平的调控
RNA的剪接与加工
RNA的转运;;RNA与转录调控;结构性RNA(占细胞总RNA的95%)
核糖体RNA(RibosomalRNA,rRNA)
转运RNA(transferRNA,tRNA)
核小RNA(smallnuclearRNA,snRNA)
核仁小RNA(smallnucleolarRNA,snoRNA)
功能性RNA(不均一RNA,占细胞总RNA的5%)
信使RNA(messengerRNA,mRNA)及其前体
非编码RNA(non-codingRNA)及其前体
microRNA
lncRNA(longnon-codingRNA);RibosomalRNA(rRNA);;以核糖核蛋白颗粒(snRNP)形式存在于细胞核内
包含U1、U2、U4、U5、U6成员
功能:与蛋白结合形成剪接体(spliceosome),参与mRNA前体的剪接(splicing);核仁小RNA(smallnucleolarRNA,snoRNA)
独立转录或来源于其他转录基因的内含子
包括H/ACA型和C/D型两种主要类型,共约40种
参与rRNA的剪切、加工(碱基修饰)与核糖体的组装;信使RNA(messengerRNA,mRNA)——遗传信息的传递者(编码蛋白产物)
成熟mRNA5’端具有帽子结构
3’端有polyA尾巴
mRNA中包含蛋白读码框
(openreadingframe,ORF
/codingsequence,cds)
非编码RNA(non-codingRNA)
——无蛋白读码框
;microRNA;长非编码RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)
长度200bp,无读码框,属不均一RNA
预测占基因组4%~9%
转录形式(来源)多样:正向、反向、双向、内含子中、基因间……
功能多样
;RNA是由RNA聚合酶(RNApolymerase)催化合成的。
以DNA为模板合成RNA的过程称为转录(transcription)
真核生物含有三种RNA聚合酶
RNApolymeraseⅠ——转录45SrRNA前体(结构性RNA)
RNApolymeraseⅡ——转录mRNA、pri-microRNA、lncRNA(不均一RNA,功能性RNA),snRNA(U1~U5)、snoRNA
RNApolymeraseⅢ——转录tRNA、5SrRNA、snRNA(U6)、少部分microRNA(小RNA,结构性RNA)
每种RNA聚合酶都包含多个亚基(~12个),聚合体总分子量超过500kDa。;;;启动RNA转录前需克服染色质的表观修饰障碍
↓
基因由表达关闭状态(非活性状态)转变为活性状态(允许转录);;启动子与增强子包含顺式作用元件
顺式作用元件(cis-actingelement):位于基因的???侧,可以调控基因表达的核酸序列。
启动子(promoter):位于转录起始点附近(通常位于起始点上游200bp的范围内),且为转录起始所必需的序列元件。
增强子(enhancer):位于距离转录起始点较远的位置上(通常几kb至几十kb),具有参与激活和增强转录起始功能的序列元件。
启动子和增强子可含有同样的顺式作用元件,通常增强子上元件密度更高,调控的组织特异性更强。;启动子和增强子中常见的顺式作用元件
启动子(Ⅱ型启动子)中的基础元件(Basallevelelement,BLE)
TATABox:位于-25~-30bp,TATAAAA/TATATAT,与基础转录因子TBP结合,启动基因转录。
GC盒(GCBox):位于约-35bp,GGCGG,与转录因子SP1结合,促进转录的过程。
CAAT盒(CAATBox):位于-70~-80bp,GGC/TCAATCT,与CTF结合,决定启动子转录效率。
一个基因的启动子
和增强子中可存在
多种不同应答元件,
其转录受到多种刺
激信号的协同调控;反式作用因子识别并结合暴露的启动子/增强子元件
反式作用因子(trans-actingfactor):能直接或间接地识别并结合在各类顺式作用元件核心序列上,对基因表达发挥不同调节作用(激活或抑制)的各类蛋白质因子。
反式作用因子的结构特点:通常具有相互独立的DNA结合结构域和转录调节结构域(蛋白相互作用结构域)
反式作用因子的分类
基本转录因子(basalfactor):不是RNA聚合酶核心酶成分,但与RNA聚合酶直接发生相互作用,基本转录复合体决定了转录起始位点(例:TBP,TATA
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