生物信息学近年原文.docx

第一章生物信息学及主要内容？

生物信息学是生物和信息技术的结合，这一学科包括了用来管理、分析和操作大量生物数据集的任何计算工具和方法。

生物信息学主要由哪三个组成部分？

生物信息学主要由三个组成部分：1?建立可以存放和管理大量生物信息学数据集的数据库； 2?开发确定大数据

集中各成员关系的算法和统计方法；3?使用这些工具来分析和解释不同类型的生物数据，包括 DNA,RNA和蛋白质

序列、蛋白质结构、基因表达以及生化途径。

数据采集的方法及原理？

一、 DNA测序一一全自动的链终止反应

原理：DNA测序是采用全自动的链终止反应完成得， 这一技术通过加入限量的双脱氧核苷酸来产生有特定终止碱基

的嵌套DNA片段，共有四种反应，每个碱基分别带有不同的荧光标记， DNA片段通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，

当每个片段移动到凝胶的末端时可以通过扫描仪读取序列。

二、 基因组测序一一霰弹测序法、克隆重叠群的方法

原理：霰弹测序法：随机打碎大 DNA分子，通过很多测序反应来覆盖整个分子，完整的序列通过使用计算机有哪些信誉好的足球投注网站

重叠区来重新拼接克隆重叠群的方法中， DNA片段用推理的方法亚克隆，并且进行系统的测序直到整个序列完成。

三、 RNA测序一一生化实验、磁核共振谱（NMR）、质谱技术（MS）原理：对已改变的核酸进行化学识别

四、 蛋白质测序一一质谱技术

原理：质谱技术可准确测定真空中离子分子质量/电荷比来计算精确的分子质量。

存储在GenBank中DNA序列的类型？

DNA序列存储在GenBank等数据库中，一般可以分为3类：基因组DNA、cDNA、重组DNA基因组测序的策略？

完整基因组的测序，首先必须把基因组分成更小的片段，再对每个片段进行单独测序。将短的读段拼接成基因组序列有两种策略。

1、 霰弹测序法：随机打碎大DNA分子，通过很多测序反应来覆盖整个分子，完整的序列通过使用计算机有哪些信誉好的足球投注网站

重叠区来重新拼接，这个方法可以快速产生大量的序列数据， 但是填补最后gap（空位）时比较困难，这个过程称为结

束阶段。

2、克隆重叠群的方法中， DNA片段用推理的方法亚克隆，并且进行系统的测序直到整个序列完成。使用这个

方法，在项目的开始阶段序列数据积累较慢，但是在结束阶段因为 gap较少，处理会比较容易。

第二章

DNA微阵列的原理及过程？

原理：核酸（DNA与RNA）可以通过杂交即互补的碱基配对形成双链分子。利用核酸杂交的特性可以标定 （例如，使用

放射或荧光标签）一个特定DNA或RNA分子探针，从而可以用于从很复杂的混合物中分离互补分子过程：阵列通常和复合RNA探针杂交，该探针是通过标定来自特定类型细胞的 RNA分子复合物得到的，这个探针

的组成反映了原始材料中单个RNA分子的表达水平。如果进行非饱和杂交，则微阵列上每个特征的信号强度表示探针上相应的RNA水平，这样可以同时把成千上万个基因的相对表达水平可视化。

按制备方式分DNA芯片的主要类型？△原位合成芯片：采用显微光蚀刻等技术在特定部位原位合成寡核苷酸而制备的芯片。

DNA微集阵列：将预先制备的DNA片段以显微打印的方式有序地固化于支持物表面而制成的芯片。用DNA芯片如何测定基因的表达差异？△

首先将DNA克隆扩增并印成微阵列，再把测试和对照的 RNA样本反转录，并用不同荧光染料着色，它们发出不同

波长的荧光，然后把RNA样本与微阵列杂交，用激光激发的手段来测量每个特征的荧光， 并且把结果转化成两个样

本中基因的相对表达水平。

双向蛋白质凝胶分离蛋白质的原理及过程？原理是蛋白质可基于两个不同的特性来分离：等电点和分子质量过程：首先第一个方向的分离通过固定的pH梯度的等电聚焦进行，然后把凝胶放在SDS中平衡，使SDS均一的结合所有的蛋白质并产生一个净负电荷，这样第二个方向上的分离就可以在分子质量的基础上进行，经过第二个方向的分离后，用一种通用的染色剂给蛋白质凝胶着色，以显示所有蛋白质斑点的位置。

研究蛋白质互作的方法，其中酵母双杂交体系的原理及过程？

遗传方法亲和性方法分子和原子方法

原理：X基因和Y基因产物的相互结合，导致 reportergene表达。Reportergene表达就可说明X基因产物于Y基因

产物能结合。

过程：1把蛋白A基因插入到BD质粒上（pGBT9）2.把蛋白B基因插入到AD质粒上（pGAD424）3.两种重组质粒共同转化酵母菌（HF7c）4.筛选观察

第三章数据库－－内容、结构和注释数据库序列的格式？

NBRF/PIR,FASTA和GDE

数据库的种类？初级数据库、辅助序列数据库数据的查询和序列提交？序列提交：NCBI上的Bankit.