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药物设计学试题
药物设计学试题及答案
名词解释
1、合理药物设计:根据药物发现过程中基础研究所揭⽰的药物作
⽤靶点,即受体,再参考其内源性配体或天然药物的化学结构特征,根据配体理化性质寻找和设计合理的药物分⼦,以便有效
发现、到达和选择性作⽤与靶点的⼜具有药理活性的先导物;或根据靶点3D结构直接设计活性配体。
2、⾼通量筛选:HTS,以分⼦⽔平和细胞⽔平的实验⽅法为基础,
以微板形式作为实验⼯具载体,以⾃动化操作系统执⾏实验过程,以灵敏快速的检验仪器采集实验数据,以计算机分析处理实
验数据,在同⼀时间检测数以万计的样品并以得到的相应数据库⽀持运转的技术体系。
3、药物的体内过程即A、D、M、E的中⽂名称及各⾃定义:分
别为
吸收:药物从⽤药部位进⼊体循环的过程。
分布:药物在⾎液、组织及器官间的可逆转运过程。
代谢:药物在吸收过程或进⼊体循环后,在体内酶系统、体液的PH或肠道菌从的作⽤下,发⽣结构转变的过程,此过程也称
为⽣物转化。
排泄:药物或其代谢物排除体外的过程。
4、基于靶点的药物设计:TBBD,以⽣命科学为基础,根据疾病特
异的功能、症状和机制,发现和研究药物作⽤靶点以及与预防相
关的调控过程。
5、基于性质的药物设计:PBBD,运⽤计算机辅助设计软件,根据
配体的理化性质对设计的先导物结构预测它们的吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADME/T),估计药物在体内的释放度和⽣
物利⽤度,判断类药性
6、基于结构的药物设计:SBDD,以计算机辅助药物设计为⼿段,
其⽅法分为基于靶点的直接药物设计和基于配体的简介药物设计两类,运⽤受体学说和分⼦识别原理,设计对受体进⾏调控的
先导物,或根据已有药物作⽤⼒⼤⼩和构效关系判断来推测新化合物的药效,达到发现活性分⼦的⽬地。
7、定量构效关系:QSAR,研究的是⼀组化合物的⽣物与其结构特
征之间的相互关系,结构特征以理化参数、分⼦拓扑参数、量⼦化学指数和结构碎⽚指数表⽰,⽤数理统计的⽅法进⾏数据回
归分析,并以数学模型表达和概括量变规律。
8、三维定量构效关系:3D-QSAR,以配体和靶点的三维结构特征为
基础,根据分⼦的内能变化和分⼦间相互作⽤的能量变化,将已知⼀系列药物的理化参数和三维结构参数与药效拟合出定量关
系,再以此化合物预测新化合物的活性,进⾏结构的优化和改造。
1、简述基于靶点结构的药物设计的基本流程。
定义活性位点→产⽣配体分⼦→配体分⼦打分→合成及活性测定→先导物
2、根据设计来源不同软药可以分为⼏种类型?软药和前药的区
别有⼏个⽅⾯?
软类似物;活化的软类似物;⽤控释内源物设计天然软药;活性代谢物;⽆活性代谢物等类型。区别:①先导物不⼀样,前药
是以原药为先导物的,软药的先导物既可以是原药也可以是原药的代谢物;②作⽤⽅式不⼀样,前药在体外⽆活性,只有到达
靶点释放出原药才有活性,⽽软药在体外是有活性的,它们到达靶点发挥治疗作⽤后⼀步代谢失活。
3、简述先导物发现的可能途径。
①筛选途径:从众多的化合物中运⽤⽣物筛选模型挑选有⽣物活
性的先导物。现代筛选途径涉及组合化学、组合库和⾼通量⾼内含筛选。
②合理药物设计:基于靶点和配体的作⽤机制、三维结构和识别
过程以及与药物理化性质相关的体内过程,进⾏有的放⽮的药物设计。
4、药物作⽤的靶点的定义及理想的药物靶点特点是什么?
靶点:也称靶标,指具有重要⽣理或病理功能,能够与药物相结合并产⽣药理作⽤的⽣物⼤分⼦及其特定的结构位点,这些⽣
物⼤分⼦主要是蛋⽩质,有⼀些是核酸或其他物质。特点:①药物作⽤于靶点对疾病治疗的有效性②药物作⽤于靶点后引起的
毒副反应⼩③便于筛选药物靶点的成药性。
5、简述药效基团的虚拟筛选⼀般流程。
⼩分⼦准备→产⽣构象→由活性分⼦⽣成药效基团的假设→优化、修改药效基团的假设→⽣成药效团模型→数据库搜寻(虚拟
筛选)
6、Lipinski的类药五倍律是什么?什么情况下该⽅法不适合预
测药物的类药性?
①相对分⼦质量<500(5×100);
②氢键供体数<5个(5×1);
③氢键受体数<10个(5×2);
④lgP<5(若使⽤ClgP)或<4.15(若使⽤MlgP)(5×1)
⑤分⼦内可旋转键数RB≤8或分⼦中环的数⽬rings≤4
⑥化合物极性分⼦表⾯积PSA≤120A2
当违反上述任意两个或多个规则时,化合物出现⼝服⽣物利⽤度差或代谢分布差的可能性就很⼤(⼤于百分之九⼗)对于抗⽣
素、抗真菌药、维⽣素及强⼼苷等具有主动转运特征的药物不适⽤
1、理想的药物靶点应具有哪些特点?
(1)药物作⽤于靶点对疾病治疗的有效性。
(2)中靶后
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