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山东农业科学2024ꎬ56(3):1~10ShandongAgriculturalSciences
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DOI:10.14083/j.issn2024.03.001
高粱SBP基因家族鉴定及干旱胁迫下
的表达模式分析
1121111
姜昱雯ꎬ陈满静ꎬ赵应ꎬ任艳ꎬ周棱波ꎬ沈佳奇ꎬ邵明波
(1.贵州省旱粮研究所ꎬ贵州贵阳550006ꎻ2.仁怀市农业农村局ꎬ贵州仁怀564500)
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摘要:在高等植物中ꎬSQUAMPromoterOSABindingProteinBoxSBP)(普遍参与植物的生长、开花调控及
细胞程序性死亡等过程ꎮ本研究对高粱(SorghumbicolorL.)SBP转录因子家族进行鉴定并进行生物信息学
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分析ꎬ同时利用qRTPCR对高粱SBP基因在PEG6000模拟干旱胁迫下的表达进行分析ꎬ以验证其功能ꎮ
结果表明ꎬ从高粱中共鉴定出19个SBP成员ꎬ除第8条染色体外ꎬ其他9条染色体上均分布有SBP基因ꎻ绝
大部分SBP蛋白在亚细胞水平定位于细胞核ꎬ且均为亲水性蛋白质ꎮ系统发育分析结果表明ꎬ与水稻类似ꎬ
这19个高粱SBP基因也可分为3个亚类ꎬ分别含有7、5个、7SBP基因ꎻ相比于拟南芥ꎬ高粱SBP与水稻、玉
米的SBP关系更近ꎮ启动子顺式作用元件预测结果显示ꎬ高粱SBP可能参与了脱落酸、茉莉酸甲酯信号通
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路ꎬ部分成员可能与植物的低温响应、昼夜节律调控有关ꎮqRTPCR分析结果显示ꎬ高粱SBP基因的表达具
有组织特异性ꎬ有17个基因受干旱胁迫诱导上调表达ꎬ且随胁迫时间的延长存在差异化表达模式ꎮ本研究结
果可为后续研究高粱SBP基因的功能提供理论依据ꎮ
关键词:高粱ꎻSBP基因家族ꎻ生物信息学分析ꎻ基因表达ꎻ干旱胁迫
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中图分类号:S514:Q78文献标识号:A文章编号2024
IdentifoicationfSorghumSBPGeneFamilandyTheir
ExpressionPatternsunderDroughtStress
JiangYuwꎬenChenManjingꎬZhaoYingꎬRenYanꎬZhouLengꎬbShenoJiaqiꎬShaoMingbo
1121111
(1.GuizInstitutehouoUpflandCroꎬGpuisy550006ꎬangChinaꎻ2.RenhuaiBureauof
AgricultureandRuralAffꎬairsRenhuai564500ꎬChina)
AbstractInthehigherplantsꎬSQUAMOSApromoterbindingprotein(SBP) ̄bisowxidelinvyolinved
plantgrowfthꎬloweringregulationandprogrammedcelldeath.InthisstudtheysorghumꎬSBPgeneswerei ̄
dentiandfiedꎬthentheirbioinfanalormaticswyassisconductedandtheirexpressionunderPEG ̄6000sim
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