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myogenicfactor:生肌调节蛋白是一种转录因子。第63页,共70页,星期六,2024年,6月DNA结合域5—同源域蛋白同源框就是一个编码含60个氨基酸结构域的基因序列。几乎所有的真核生物蛋白都拥有这一结构域。最初来自于果蝇上的同源位点(这个基因决定果蝇身体结构的特征)。在调控果蝇早期发育的许多基因中都有这一同源序列,而且在很大范围的高等真核生物的基因上发现相关的超二级结构。果蝇的同源基因中,同源域经常(并非总是)出现在靠近C末端第64页,共70页,星期六,2024年,6月同源域(Homeodomain)蛋白通过其第三个螺旋与双链DNA的大沟相结合,其N端的延伸部分则与DNA的小沟相结合,提高了稳定性第65页,共70页,星期六,2024年,6月ThehomeodomainmaybethesoleDNA-bindingmotifinatranscriptionalregulatorormaybecombinedwithothermotifs.Itrepresentsadiscrete(60residue)partoftheprotein.第66页,共70页,星期六,2024年,6月Thehomeodomainisconventionallynumberedfrom1to60.ItstartswiththeN-terminalarm,andthethreehelicalregionsoccupyresidues10-22,28-38,and42-58.
比较了三个螺旋区的序列,序列保守性最多的部分在第三个螺旋第67页,共70页,星期六,2024年,6月Helix3ofthehomeodomainbindsinthemajorgrooveofDNA,withhelices1and2lyingoutsidethedoublehelix.Helix3contactsboththephosphatebackboneandspecificbases.TheN-terminalarmliesintheminorgroove,andmakesadditionalcontacts.果蝇锯齿状基因编码的同源域的晶体结构。螺旋-3和DNA的大沟结合,形成蛋白与DNA接触的主要部分。同源域的N端臂,伸进了DNA的小沟,与DNA也有接触。也就是说,与DNA结合主要是同源域的C端和N端区域。第68页,共70页,星期六,2024年,6月转录激活结构域酸性激活结构域:在酵母Gcn4和Gal4的转录激活结构域,哺乳动物糖皮质激素受体以及疱疹病毒激活子VP16发现都含有高比例的酸性氨基酸,成为酸性激活结构域。富含谷氨酰胺结构域:首次在转录因子SP1上4个激活域上发现,在转录活性最强的活化域上很少极性氨基酸,却富含谷氨酰胺。富含脯氨酸结构域:在AP2和Oct2等转录因子上发现富含脯氨酸的区域,很少能够形成a-螺旋。第69页,共70页,星期六,2024年,6月感谢大家观看第70页,共70页,星期六,2024年,6月***Transcriptionallyactivechromatinregionstendtobehyperacetylatedandhypomethylated.?IfaregionofDNAorageneisdestinedforsilencing,chromatinremodelingenzymessuchashistonedeacetylasesandATP-dependentchromatinremodelerslikelybeginthegenesilencingprocess.?OneormoreoftheseactivitiesmayrecruitDNAmethyltransferaseresultinginDNAmethylation,followedfinallybyrecruitmentofthemethyl-CpGbindingproteins.?TheregionofDNAwillthenbeheritablymaintainedinaninactivestate.***InheritanceoftheDNAmethylationpattern.?TheDNAmethyltransferasecan
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