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#数据库#PHI-base病原体-宿主互作数据库

Peaker

PHI（pathogen-hostinteractions）病原体-宿主互作数据库，包含了

大量病原体与宿主互作致病的数据资源，包括大量经过专业校正的分

子与生物学信息，标识了对病原体作用宿主后outcome的影

响以及生物学行为。PHIbase数据库的建立是为了给出一些抗的

化学反应信息，用于抗的临床治疗。

数据库主页

在主界面最上方菜单栏包括search检索，about关于，releasenote

版本记录，download等。下方为主界面，包括quicksearch快速检

索和advanced高级检索。在quicksearch中，用户可以输入名，

宿主，文献ID，或PHIbaseaccession，输入，通过，疾病，

病原体等类别进行order排序，点击GO即可输出结果。

对于高级检索，用户可以选择输入的内容包括，疾病，宿主，

病原体，抗等信息进行查询。各个词条term之间的关系可以是

AND或OR的关系，点击GO即可查询。

在高级检索中需要是，用户可以选择抗治疗相关化合物或

药物信息作为过滤筛选，同时也可以选择表型信息，例如致病性降低，

减低毒性等。由于PHIbase所有数据都经过严格的专业校正，所以这

里也提供了evidence，用户可以选择来自不同验证类型的evidence。

例如我们以ACE为例，利用高级检索查询，选择植物物种，获得

如下结果

我们检索到一个匹配的词条，PHIaccession为PHI325名ACE1，

表型为非致病性因素，涉及到的致病菌为稻瘟病菌，疾病名为稻瘟病，

宿主为RICE。

点击accession可以跳转到NCBI查看详细信息，如点击ACCID

CAG28797则可以跳转到下面界面

点击病原体信息，Magnaporthegrisea可以进入下面界面，记录了相关

病原体的详细数据信息。

点击红框内病原体名，可以跳转到detailed信息

包括病原体的分类ID，名字，遗传编码，同义名等。

对于E