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实验五动物肝脏中DNA的制备和鉴定学时:6掌握动物组织总DNA的提取方法及其原理。学习核酸染色的方法。掌握琼脂糖凝胶电泳分离核酸的原理和方法。010203一、实验目的:二、实验原理:要获得纯的DNA样品,必须考虑以下几点:如何选材,如何破碎组织细胞?如何除去蛋白质?(在真核细胞内,DNA与蛋白质结合成核蛋白的形式存在。因此,分离DNA时必须使其与蛋白质解离,并除去蛋白质。)设法除去RNA的污染;防止DNA酶的降解作用;(一)动物肝脏DNA制备原理选材要提取动物组织DNA,一般选择细胞膜较脆弱,容易破碎的动物脏器,如胸腺、肝脏、脾脏、胰脏等。研磨:将剪碎的动物组织置于研钵或匀浆器中,加入少量石英砂研磨或匀浆,破碎细胞。这种方法温和,适合实验室使用。01组织捣碎器:较剧烈的破碎细胞的方法,为了防止发热和升温过高,通常是转10秒—20秒,停10秒—20秒,可反复多次。02压榨法:在1000×105Pa—2000×105Pa的高压下使几十毫升的细胞悬液通过一个小孔突然释放至常压,细胞将彻底破碎。温和的、彻底破碎细胞的方法,但仪器费用较高。03细胞破碎方法—机械物理法:反复冻融法:将待破碎的细胞冷至-15℃到-20℃,然后放于室温(或40℃)迅速融化,由于细胞内形成冰粒使剩余胞液的盐浓度增高而引起细胞溶胀破碎。超声波处理法:借助超声波的振动力破碎细胞壁和细胞器。使用时注意降温,防止过热。冷热交替法:在90℃左右维持数分钟,立即放入冰浴中使之冷却,如此反复多次,绝大部分细胞可以被破碎。细胞破碎方法—机械物理法溶胀法:细胞膜为天然的半透膜,在低渗溶液和低浓度的稀盐溶液中,由于存在渗透压差,溶剂分子大量进入细胞,将细胞膜胀破释放出细胞内含物。有机溶剂处理法:利用氯仿、甲苯等脂溶性溶剂或SDS(十二烷基硫酸钠)等表面活性剂处理细胞,可将细胞膜溶解,从而使细胞破裂,此法也可以与研磨法联合使用。0201细胞破碎方法—化学方法(三)除去RNA的方法脱氧核糖核蛋白在浓NaCl(1-2mol/L)溶液中溶解度很大,但在0.14mol/LNaCl溶液中溶解度很低,而核糖核蛋白则溶于0.14mol/LNaCl溶液中,利用这一性质可将脱氧核糖核蛋白与绝大部分核糖核蛋白分离开来。用氯仿一异成醇混合液振荡核蛋白溶液,使蛋白质变性,然后离心除去变性蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA溶于上层水相。用两倍体积95%乙醇溶液可将DNA钠盐沉淀出来。用十二烷基硫酸钠(SDS)等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA。0102(四)除去蛋白质的方法01为了防止DNA酶的降解,提取时可加入适量EDTA(乙二胺四乙酸)、柠檬酸,以降低DNA酶的活性。02加入RNA酶降解剩余的RNA,获得纯的DNA。03保存:将DNA于滤纸上干燥,溶于1mlTE中低温保存。纯的DNA样品的获得琼脂糖凝胶电泳分离核酸的原理:琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖凝胶作为支持介质的一种电泳分离方法,是一种简便、快速分离鉴定核酸的方法,已成为分子生物学及基因工程研究中常用实验方法之一。琼脂糖英文名agarose,是从琼脂中提取出来的,由半乳糖和3.6-脱水-L-半乳糖相互结合的链状多糖。琼脂糖和琼脂都可在不同浓度的水溶液下可形成多孔的凝胶,电泳中具有分子筛效应。但琼脂糖含硫酸根比琼脂少,电渗作用降低,因而分离效果明显提高。0102DNA分子泳动速率的大小除与DNA分子的带电量有关外,还与DNA分子的大小和空间构象有关(琼脂糖凝胶的分子筛效应)。溴化乙啶是一种荧光染料,可插入DNA双螺旋结构的两个碱基对之间,与DNA分子形成络合物,在紫外光的激发下发出橙黄色的荧光。DNA分子在pH高于其等电点的溶液中带负电荷,在电场中向正极移动(电荷效应)。电泳时,用溴酚蓝做前沿指示剂,用溴化乙啶(ethidiumbromide,EB)指示DNA样品在凝胶中的确切位置。01020304荧光来自两方面,一是核酸吸收260nm的紫外光,并将能量传给EB;二是EB本身吸收波长为302nm和360nm的紫外光。这两方面的能量最终激发EB发出波长为590nm的红橙色荧光。01溴化乙啶可加入凝胶中,也可以在电泳后,将凝胶放在含EB的溶液中浸泡.02溴化乙啶检测DNA的灵敏度很高,可检出10ng甚至更少的DNA。03琼脂糖凝胶电泳分离核酸的影响因素(1)核酸大小与琼脂糖凝胶电泳分离的关系
凝胶中,DNA片段迁移率与DNA分子大小(碱基对的对数)成反比(≤20kb),因此通过已知大小的标准物移动
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