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QX200软件使用指南
(以英文原版操作手册为准)
1.打开电脑中的QuantaSoft软件,如果QX200DropletReader仪器已开启且连接正常,会在软件界面的右上方出现“InstrumentRoutines”的面板,其中“Prime”和“FlushSystem”两项用于日常维护(其他不常用),“Prime”用于更换ReaderOil或者一周以上未用仪器再次使用前用ReaderOil重新填充管路,“FlushSystem”建议在每天第一次实验前运行清洗下管路和取样针。注:仅当仪器中放入PlateHolder时以上命令才能运行。
2.软件使用主要分为三步,如界面左边的导航条所示,“Setup”用于设定实验布局,提供96孔板中对应位置的样品、assay及实验类型信息;“Run”指导QX200DropletReader运行微滴检测;“Analyze”分析结果,计算核酸浓度等。软件可能用到的文件类型有:*.qlt文件为用户定义的板面布局文件(不含数据结果);*.qlb文件为每个设定孔的原始数据文件(未经分析);*.qlp文件为对设定的板面分析后的数据结果文件;*.csv文件为数据结果输出文件,可用Excel等打开查看。
3.Setup
点击导航条中的“Setup”,从软件界面左上方的“Setup”面板中
可以新建布局(TemplateNew),导入布局(TemplateLoad)或者导
入已经完成实验和分析的结果文件(PlateLoad),均可以另存为(Save
As)至其他路径。注:默认布局文件存储于安装盘如
C:\QuantaLife\Templates目录下,默认数据结果文件存储于安装盘如
C:\QuantaLife\Data目录下。
4.WellEditor
在软件界面下方选择要编辑的孔,单击操作为选中孔(显示为灰色背景),可按住“Ctrl”或“Shift”进行多选,也可点选行列号选择一行或一列,或者点击左上角的“*”号选择整板;双击操作为调出孔编辑器 (WellEditor),同时显示出选中孔内已编辑的内容(未编辑为空)。如下图所示,输入样品名称,选择实验类型(ABS、RED或CNV),选择使用的Supermix类型,分别输入Target1(对应FAM通道即Ch1)和Target2(对应HEX/VIC通道即Ch2)中的目标基因名称、样品类型。其中样品类型包括:
Unused—未使用;Unknown—未知样品;Reference—参照基因;Positive—阳性对照;Negative—阴性对照;Blank—无样品(不会被分析);NTC—无模板对照
6.Run
编辑或者改动孔信息完成后,注意WellEditor中的Apply方框内是否都打上√,只有打上√的点击下方“Apply”按钮才会有效,完成后点击“OK”保存改动并退出WellEditor。
注:实验完成后仍然可以返回“Setup”界面修改已完成实验的孔内信息以重新分析;AutoInc的框内打上√会在写入的name后自动添加此孔编号如RPP30变为RPP30A05;AppliedWellSettings中可以预览编辑好的内容;Ctrl+C、Ctrl+V可以复制一个孔信息至另外一个孔,Ctrl+Z可以返回上一步操作。
5.ExperimentEditor
在上面的WellEditor中SampleName下的Experiment下拉菜单中可以选择已有的实验类型,或者通过点击“addexperiment…”修改、删除已有实验类型或新建一个类型并命名,调出的面板如下,双击右边框内已有的实验类型名称可以修改或删除(Remove),新建类型直接在Name框内输入新名称,并在下方选择三种类型(绝对定量ABS,稀有事件检测RED,拷贝数变异CNV)之一。
注:仅当实验类型为CNV时才会有ReferenceCopies设定项出现,输入的数字代表参照基因在一个基因组中的拷贝数目。
参照基因拷贝数设定仅出现在CNV实验类型中
设置实验类型标示的前景色和背景色
可以对实验类型做注释(Comments),设置类型标示的前景色和背景色,完成后点“Apply”使改动生效,点击“OK”保存并退出ExperimentEditor面板。
对反应孔板信息编辑完成后即可以点击
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