RNA 测序方法合集(以 Illumina® 技术为特色的 RNA 测序文献综述).docx

RNA测序方法合集

近期以Illumina?技术为特色的RNA测序文献综述

2RNA测序方法合集

目录

6简介

7RNA转录

8RNA-Seq：RNA测序

10CaptureSeq：RNA捕获测序

11RASL-Seq：RNA介导的寡核苷酸退火、选择和连接及新一代测序

12ClickSeq：利用随机终止的3-叠氮阻断cDNA片段构建的RNA测序文库

133Seq：用于表达定量的3末端测序

14cP-RNA-Seq：2,3-环磷酸(cP)RNA测序

153P-Seq：利用测序分析Poly(A)位点

162P-Seq：Poly(A)尾引物测序

173-Seq：定量3UTR异构体的丰度

18TIF-Seq：转录异构体测序

19PEAT：转录起始位点的双端分析

20SMORE-Seq：在测序的同时进行RNA末端定位

21TL-Seq：转录本前导序列测序

22TATL-Seq：翻译相关的转录本前导序列测序

23RARseq：限制性位点相关的RNA测序

24TAIL-Seq：Poly(A)尾测序

25PAL-Seq：利用测序分析Poly(A)尾长度

26FRT-Seq：流动槽逆转录测序

27ChIRP：通过RNA纯化进行染色质分离

28CHART：RNA靶标的捕获杂交分析

29RAP：RNA反义纯化

30GRO-seq：全局连续测序

32Bru-Seq：溴尿苷测序

33BruChase-Seq：溴尿苷脉冲追踪测序

345-GRO-Seq：5全局连续测序

35BruDRB-Seq：溴尿苷5,6-二氯苯并咪唑1-β-D-呋喃核糖苷测序

364sUDRB-Seq：4-硫尿核苷和5,6-二氯苯并咪唑1-β-D-呋喃核糖苷测序

38PRO-Seq：精确核连续测序

39PRO-Cap：RNA聚合酶II起始位点的精确核连续测序

40CAGE：帽分析基因表达测序

413NT方法：新生转录本的3末端

42NET-Seq：天然延伸转录本测序

43mNET-Seq：用于哺乳动物染色质分析的天然延伸转录本测序

44PARE-Seq：RNA末端测序的平行分析

45GMUCT：未加帽和切割转录本的基因组定位

近期以Illumina技术为特色的RNA测序文献综述3

4RNA测序方法合集

46RNA–蛋白质相互作用

47Ribo-Seq或ARTSeq：核糖体分析测序

49RIP-Seq：RNA免疫沉淀测序

50CLIP-Seq或HITS-CLIP：CLIPcDNA文库的高通量测序

52PolIICLIP：RNA聚合酶II交联和免疫沉淀

53miR-CLIP：MicroRNA交联和免疫沉淀

54eCLIP：增强的交联免疫沉淀

55irCLIP：UV-C交联和免疫沉淀

56PAR-CLIP：光激活核糖核苷增强的交联和免疫沉淀

58iCLIP：单核苷酸分辨率CLIP

60BrdU-CLIP：BrdU亲和纯化CLIP

61AGO-CLIP:Argonaute交联免疫沉淀

62PIP-Seq：蛋白质相互作用分析测序

63hiCLIP：RNA杂交及单核苷酸分辨率紫外交联和免疫沉淀

64RBNS：RNABind-n-Seq测序

65TRIBE：通过编辑识别RNA结合蛋白的靶向位点

66HiTS-RAP：高通量测序-RNA亲和性分析

67TRAP-Seq：多核糖体mRNA靶向纯化

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