泛素酶:泛素化研究的基石,PROTAC开发的核心.pdf

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泛素酶:泛素化研究的基石,PROTAC开发的

核心

泛素酶与PROTAC

蛋白质作为生命活动的主要承担者,在完成使命后需要及时启动降解

和清除。如果在这个过程中出现问题,就会引发一系列疾病,最典型

的当属神经退行性疾病,如阿尔茨海默症、帕金森、亨廷顿病等。

人体细胞降解蛋白质的主要途径有泛素-蛋白酶体系统(UPS)和溶酶

体-自噬通路。PROTAC是一种新兴治疗方式,利用UPS选择性的靶向

降解疾病相关的蛋白质,调节小分子药物难靶向的“不可成药”靶点。

因此,PROTAC概念自2001年首次报道以来,受到科研界和药企的广

泛关注。

SignalChemBiotech(义翘神州全资子公司)凭借20多年为泛素研

究提供高活性重组酶蛋白和底物的经验,已成功开发泛素、E1泛素

激活酶、E2泛素结合酶、E3泛素连接酶、去泛素化酶等一系列产品。

“一键三连”泛素化

研究发现80%-90%的蛋白质降解由泛素-蛋白酶体系统(UPS)介导完

成。

UPS俨然是人体的一个蛋白质“垃圾处理站”。泛素“一键锁定”靶

蛋白,标记为待处理的垃圾,即“泛素化”。通过E1泛素激活酶、

E2泛素结合酶、E3泛素连接酶实现“三连击”,将靶蛋白进行集中

处理,接收信号并降解靶蛋白。

泛素-蛋白酶体系统(源自文献:doi:10.1038/s41568-021-00365-x)

泛素,因其广泛存在于真核生物的各类细胞中而得名。泛素在人类基

因组中有4个基因编码:UBB、UBC、UBA52和RPS27A。其中RPS27A

和UBA52编码单拷贝的泛素,与核糖体蛋白L40和S27a形成融合蛋

白。UBB和UBC则表达多拷贝泛素前体。成熟的泛素有76个氨基酸

且高度保守,其中甲硫氨酸和赖氨酸对于泛素链形成尤为重要。

泛素酶的接力:E1泛素激活酶催化泛素并通过巯酯键结合在一起,

随后E2泛素结合酶通过巯基置换,取代E1,将泛素结合到E2上。

泛素化的E2蛋白和E3泛素连接酶以及底物形成复合体。在E3的催

化作用下,将泛素的羧基末端与靶蛋白赖氨酸残基间形成氨基异肽键,

从而将泛素转移到靶蛋白上。最后通过26S蛋白酶体降解泛素化标记

的蛋白质。

泛素化过程中的关键酶

E1泛素激活酶

E1进化上保守,属于ATP依赖酶,通过与泛素C端形成高能硫脂键

而激活泛素。在结构上E1可以被分为4个功能区:腺苷化结构区(催

化ATP与泛素形成泛素腺苷酸中间体)、半胱氨酸催化区(催化泛素

和半胱氨酸形成巯酯键)、4HB(维持E1结构)、泛素折叠区(招募

特异性的E2蛋白)。在人体中E1泛素激活酶除了UBA1和UBA6,还

有其它结构类似的蛋白,同样具有E1激活酶的作用,如UBA2、UBA3、

UBA4、UBA7等。

E2泛素结合酶

大约有40余种,在结构上具有UBC结构域,还有3个loop环,loop1

和loop2是E3酶的结合区,loop3含有半胱氨酸,是泛素结合区。

E2突变与疾病发生相关,如UBE2D2/3、UBE2L3、UBE2N和UBE2R1与

帕金森症密切相关,UBE2L3和类风湿关节炎等自身免疫病相关,UBE2C、

UBE2D与不同肿瘤发生机制相关。

E3泛素连接酶

目前已超过600多种。按照结构可以分为3类:RINGE3、HETCE3

和RBRE3连接酶。E3连接酶和底物直接相关,在体内生物学功能中

发挥重要作用。E3连接酶的突变与多种疾病相关,如MDM2通过影响

p53的稳定性调控癌症进展。Parkin功能缺失导致线粒体外膜蛋白无

法正常代谢,进而引发帕金森病。E3连接酶BRCA1是乳腺癌的标志

物之一。

PROTAC:让泛素化实现临床转化

泛素化调节蛋白质的稳定性、功能、亚细胞定位及相互作用,广泛参

与免疫反应调控、DNA损伤修复、细胞周期调控、细胞增殖凋亡等几

乎所有的生命活动。一旦失调将可能引发癌症、免疫疾病、神经退行

性疾病、代谢综合征等病变。

靶向蛋白降解嵌合体(PROTAC)利用细胞的天然泛素-蛋白酶体系统,

选择性地降解致病蛋白质,调节传统小分子难以靶向的“不可成药”

蛋白。

PROTAC通过两个连接子(Linker)连接的配体形成异双功能小分子

降解剂,一端负责结合目的蛋白(POI),另一端招募并结合E3泛素

连接酶。PROTAC同时结合目的蛋白和连接酶,形成E3-降解剂-POI

三元复合物诱导目的蛋白泛素化,并随后被26S蛋白酶体降解,进而

实现抑制肿瘤生长的目标。整个过程中PROTAC分子可以重复回收利

用,靶向目的蛋白。

PROTAC结构示意图(源自

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