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泛素酶:泛素化研究的基石,PROTAC开发的
核心
泛素酶与PROTAC
蛋白质作为生命活动的主要承担者,在完成使命后需要及时启动降解
和清除。如果在这个过程中出现问题,就会引发一系列疾病,最典型
的当属神经退行性疾病,如阿尔茨海默症、帕金森、亨廷顿病等。
人体细胞降解蛋白质的主要途径有泛素-蛋白酶体系统(UPS)和溶酶
体-自噬通路。PROTAC是一种新兴治疗方式,利用UPS选择性的靶向
降解疾病相关的蛋白质,调节小分子药物难靶向的“不可成药”靶点。
因此,PROTAC概念自2001年首次报道以来,受到科研界和药企的广
泛关注。
SignalChemBiotech(义翘神州全资子公司)凭借20多年为泛素研
究提供高活性重组酶蛋白和底物的经验,已成功开发泛素、E1泛素
激活酶、E2泛素结合酶、E3泛素连接酶、去泛素化酶等一系列产品。
“一键三连”泛素化
研究发现80%-90%的蛋白质降解由泛素-蛋白酶体系统(UPS)介导完
成。
UPS俨然是人体的一个蛋白质“垃圾处理站”。泛素“一键锁定”靶
蛋白,标记为待处理的垃圾,即“泛素化”。通过E1泛素激活酶、
E2泛素结合酶、E3泛素连接酶实现“三连击”,将靶蛋白进行集中
处理,接收信号并降解靶蛋白。
泛素-蛋白酶体系统(源自文献:doi:10.1038/s41568-021-00365-x)
泛素,因其广泛存在于真核生物的各类细胞中而得名。泛素在人类基
因组中有4个基因编码:UBB、UBC、UBA52和RPS27A。其中RPS27A
和UBA52编码单拷贝的泛素,与核糖体蛋白L40和S27a形成融合蛋
白。UBB和UBC则表达多拷贝泛素前体。成熟的泛素有76个氨基酸
且高度保守,其中甲硫氨酸和赖氨酸对于泛素链形成尤为重要。
泛素酶的接力:E1泛素激活酶催化泛素并通过巯酯键结合在一起,
随后E2泛素结合酶通过巯基置换,取代E1,将泛素结合到E2上。
泛素化的E2蛋白和E3泛素连接酶以及底物形成复合体。在E3的催
化作用下,将泛素的羧基末端与靶蛋白赖氨酸残基间形成氨基异肽键,
从而将泛素转移到靶蛋白上。最后通过26S蛋白酶体降解泛素化标记
的蛋白质。
泛素化过程中的关键酶
E1泛素激活酶
E1进化上保守,属于ATP依赖酶,通过与泛素C端形成高能硫脂键
而激活泛素。在结构上E1可以被分为4个功能区:腺苷化结构区(催
化ATP与泛素形成泛素腺苷酸中间体)、半胱氨酸催化区(催化泛素
和半胱氨酸形成巯酯键)、4HB(维持E1结构)、泛素折叠区(招募
特异性的E2蛋白)。在人体中E1泛素激活酶除了UBA1和UBA6,还
有其它结构类似的蛋白,同样具有E1激活酶的作用,如UBA2、UBA3、
UBA4、UBA7等。
E2泛素结合酶
大约有40余种,在结构上具有UBC结构域,还有3个loop环,loop1
和loop2是E3酶的结合区,loop3含有半胱氨酸,是泛素结合区。
E2突变与疾病发生相关,如UBE2D2/3、UBE2L3、UBE2N和UBE2R1与
帕金森症密切相关,UBE2L3和类风湿关节炎等自身免疫病相关,UBE2C、
UBE2D与不同肿瘤发生机制相关。
E3泛素连接酶
目前已超过600多种。按照结构可以分为3类:RINGE3、HETCE3
和RBRE3连接酶。E3连接酶和底物直接相关,在体内生物学功能中
发挥重要作用。E3连接酶的突变与多种疾病相关,如MDM2通过影响
p53的稳定性调控癌症进展。Parkin功能缺失导致线粒体外膜蛋白无
法正常代谢,进而引发帕金森病。E3连接酶BRCA1是乳腺癌的标志
物之一。
PROTAC:让泛素化实现临床转化
泛素化调节蛋白质的稳定性、功能、亚细胞定位及相互作用,广泛参
与免疫反应调控、DNA损伤修复、细胞周期调控、细胞增殖凋亡等几
乎所有的生命活动。一旦失调将可能引发癌症、免疫疾病、神经退行
性疾病、代谢综合征等病变。
靶向蛋白降解嵌合体(PROTAC)利用细胞的天然泛素-蛋白酶体系统,
选择性地降解致病蛋白质,调节传统小分子难以靶向的“不可成药”
蛋白。
PROTAC通过两个连接子(Linker)连接的配体形成异双功能小分子
降解剂,一端负责结合目的蛋白(POI),另一端招募并结合E3泛素
连接酶。PROTAC同时结合目的蛋白和连接酶,形成E3-降解剂-POI
三元复合物诱导目的蛋白泛素化,并随后被26S蛋白酶体降解,进而
实现抑制肿瘤生长的目标。整个过程中PROTAC分子可以重复回收利
用,靶向目的蛋白。
PROTAC结构示意图(源自
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