二代测序技术在非小细胞肺癌中的临床应用.pptVIP

NGS+ctDNA有助于肿瘤的早期发现JillianPhallenetal.,SciTranslMed.2017Aug16;9(403)Jillian运用基于NGS平台的目标错误校正测序(TEC-Seq)方法，对ctDNA的序列变化进行超灵敏的直接评估发现：健康人群中未检出肿瘤特异性基因突变；以健康人作为对照，乳腺癌、肺癌、卵巢癌、结直肠癌患者都检测到了肿瘤特异性突变；早期肿瘤就能够检出肿瘤特异性基因突变；检测肿瘤特异性基因突变与癌症的临床分期呈正比Jillian认为基于NGS平台的TEC-Seq分析方法为早期肿瘤的无创检测提供了广泛适用的方法，可能对癌症患者的筛查和管理有用，提示ctDNA用于常见癌种早期诊断的可能性。*DNA测序（DNAsequencing，或译DNA定序）是指分析特定DNA片段的碱基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤的（G）排列方式。测序技术能够真实地反映基因组DNA上的遗传信息，进而比较全面地揭示基因组的复杂性和多样性，因而在生命科学研究中扮演了十分重要的角色。Sanger法的发明，让DR.Fred斩获2枚诺贝尔。Sanger法，是针对已知致病基因的突变位点设计引物，进行PCR扩增，直接测序。单个突变点的扩增(包括该位点在内的外显子部分片段的扩增)，不必将该点所在基因的全部外显子都扩增。优势在于精准，流程细致，质控环节多，污染低，结果直观可视，假性结果极低，阳性就是真阳性。但是Sanger法通量太低，不能满足大规模检测基因突变的要求．进入21世纪后，以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标志的二代测序技术诞生了。二代测序技术以高通量、速度快、低成本为主要特征，可直接通过聚合酶或连接酶进行体外测序合成。第三代测序技术与前两代相比，他们最大的特点就是单分子测序，测序过程无需进行PCR扩增。第三代测序技术通过现代光学、高分子、纳米技术等手段来区分碱基信号差异的原理，以达到直接读取序列信息的目的，三代测序设备在DNA序列片段读长上优于二代设备，但在准确度上较二代设备差，目前尚未完全成熟，市场应用面还不算广。综述所述，DNA测序技术多种多样，但二代测序方法，能检测到基因组上稀有的突变，而且能够全面地勾勒出基因组上变异图谱，由于其在检测基因突变中的高通量、速度快、灵敏度高等优点，在众多平台中脱颖而出，近年来已广泛地应用到检测基因突变领域。*Sanger法，是针对已知致病基因的突变位点设计引物，进行PCR扩增，直接测序。单个突变点的扩增(包括该位点在内的外显子部分片段的扩增)，不必将该点所在基因的全部外显子都扩增。优势在于精准，流程细致，质控环节多，污染低，结果直观可视，假性结果极低，阳性就是真阳性。但是Sanger法通量太低，不能满足大规模检测基因突变的要求．三代测序设备在DNA序列片段读长上优于二代设备，但在准确度上较二代设备差，目前尚未完全成熟，市场应用面还不算广。二代测序方法，能检测到基因组上稀有的突变，而且能够全面地勾勒出基因组上变异图谱，由于其在检测基因突变中的高通量、速度快、灵敏度高、测序成本低等优点，在众多平台中脱颖而出，近年来已广泛地应用到检测基因突变领域。*目前，NIPT已经有2家上市公司，国家卫计委及CFDA已经有规范的政策文件，部分地区市场定价且可以医保报销，NIPT行业及市场占有率基本稳定。目前，PGD/PGS在临床上应用面临着很多困难及争议，没有足够的证据证明PGS能有效改善植入率和活产率，存在活检操作难、费用高等客观问题，及伦理主观问题。目前，全世界遗传性疾病有4000余种，NGS成为鉴定罕见病新致病基因最重要的研究工具，但基因诊断在数据共享、数据分析、专业的遗传咨询等方面都存在瓶颈目前，NGS在肿瘤方向应用的进展迅速，近几年肿瘤方向的基因检测公司如雨后春笋约200家公司，市场份额还在不断扩大，各种法规政策也在不断的完善过程中，未来的发展空间很大，前景广阔****2018年推荐所有肺腺癌患者都必须进行ROS1检测，将BRAF、RET、HER2、KARS、MET纳入初诊或常规EGFR、ALK和ROS1检测结果阴性时较大检测panel的一部分***NGS技术在非小细胞肺癌精准治疗中的应用DNA测序技术简介非小细胞肺癌精准治疗概述NGS检测技术贯穿非小细胞肺癌精准治疗全程DNA测序技术简介PART01DNA测序技术的发展历程孙海汐,王秀杰.DNA测序技术发展及其展望[J].科研信息化技术与应用,2009(03):18-29.20世纪中叶至20