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第一节DNA重组(recombination)
一)、DNA重组
1、概念:是指由于不同DNA链的断裂和连接而产生的DNA片段的交换和重新组合,形成新
的DNA分子的过程。
2、意义:重组是遗传学的灵魂,没有重组就没有生物的进化;没有重组也就没有现代的分子克
隆技术
二)、DNA重组的类型
1、同源重组(HomologousRecombination)
2、位点特异性重组(Site-specificRecombination)
3、DNA的转座(transposition)
同源重组
一、概述
1、定义:两个DNA分子同源序列之间进行的重组
2、条件:
(1)两个DNA分子有同源序列
(相关的酶可以用任何一对同源序列为底物)
(2)两个DNA分子必须紧密接触
3、发生:
真核生物:非姐妹染色单体交换相对应的区域。
原核生物:依赖recA蛋白,并形成Holliday结构
Holiday模型(1964年)
二、大肠杆菌同源重组的分子基础
(一)RecA
1、作用:可促进单链同化或单链吸收
RecA具有使DNA单链置换双链中同源链的能力
2、单链同化发生的三个条件
(1)其中一个DNA必须存在单链区
(2)其中一个DNA必须有一个自由3’末端
(3)此单链区和3’末端必须位于两分子之间互补的区域内
(二)RecBCD复合体
1、酶的活性:
(1)核酸酶
(2)解旋酶
(3)ATPase
2、作用:在CHi位点处产生含3`游离末端单链。
(三)CHi位点——RecBCD识别的靶位点
5`GCTGGTGG3`
3`CGACCACC5`
是重组频率较高的部位
E.coli每隔约5~10kb有一个拷贝,
Holliday结构的形成:
1.同源序列排列在一起;
2.酶切。通过核酸酶和RecBCD蛋白复合体的作用在一对同源DNA上产生切口;
3.入侵。含有3’端切口的ssDNA被recA蛋白包裹形成recA蛋白-ssDNA细丝;RecA-ssDNA
细丝寻找相对的DNA双螺旋上的相应序列。
4.游离端交叉连接,形成Holliday结构
5.通过分支迁移产生异源双链DNA。
6.空间重排。十字型两臂旋转180度
7.解离(两种不同方式)
8.修补连接
附:基因敲除(Geneknockout)
是80年代后半期应用DNA同源重组原理发展起来的一门新技术是指对一个结构已知但功
能未知的基因,从分子水平上设计实验,将该基因去除,或用其它顺序相近基因取代,然
后从整体观察实验动物,推测相应基因的功能。
位点特异性重组
一、定义:
不依赖于DNA顺序的同源性,而依赖于能与某些酶相结合的特异的DNA序列的存在。
二、噬菌体λ对E.coliDNA的整合
(一)λDNA存在两种形式
裂解状态
溶源状态
(二)通过位点特异性重组实现两种类型间的转换
λDNA整合到宿主DNA进入溶源状态
λDNA从宿主DNA中切离进入裂解状态
(三)催化重组的酶
1、整合酶Int(integrase):有拓扑异构酶活性
2、整合宿主因子(IHF,integrationhostfactor)
3、切除酶(excisionase)/终止重组
(四)重组位点:
附着位点(attachmentsite)
attP(POP’)和attB(BO
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