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西番莲叶绿体基因组密码子偏好性分析
摘要：将西番莲的叶绿体基因组中挑选出的51条蛋白质编码基因序列分析其偏好性，此研究利用Condow、SPSS软件来计算并获得了各个基因密码子3个位置的GC含量和3个位置的ENC值以及所有基因序列的RSCU值。结果表明：西番莲叶绿体基因的有效密码子数（ENC）在38.88~61.00之间，其密码子的使用偏好性比较弱。经过分析，RSCU1共有30个密码子，其中有16个密码子是以U结束，13个密码子以A结束，1个密码子以G结束，表明第3位密码子碱基偏好A、U结束。在中性绘图分析中，可以得出GC12与GC3无明显相关性，回归系数为0.4423，说明西番莲叶
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