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基因芯片——“生物信息精灵”

——浅谈数学、计算机在现代生命科学研究中的作用

二十世纪是物理科学的世纪,而二十一世纪则是生命科学的世纪。

生命科学,尤其是生物技术的迅猛发展,不仅与人类健康,农业发展

以及生存环境密切相关,而且还将对其它学科的发展起到促进作用,

所谓所谓今天的科学,明天的技术,后天的生产今天的科学,明天的技术,后天的生产。而生命科学的基础性

研究是现代生物技术的源泉、科学和技术创新的关键。

现代生物技术,是一门领导尖端科技的学科,正因如此,我很想

知道它与数学——我得专业课,计算机等理论或技术是怎样有机的联

系在一起的。基于此,我利用课余时间查阅了许多网站、书籍,并有

了小小的收获。现就“基因芯片”技术,浅谈如下。

一、基因芯片简介

基因芯片,也叫DNA芯片,是在90年代中期发展出来的高科技

产物。基因芯片大小如指甲盖一般,其基质一般是经过处理后的玻璃

片。每个芯片的基面上都可划分出数万至数百万个小区。在指定的小

区内,可固定大量具有特定功能、长约20个碱基序列的核酸分子(也

叫分子探针)。

由于被固定的分子探针在基质上形成不同的探针阵列,利用分子

杂交及平行处理原理,基因芯片可对遗传物质进行分子检测,因此可

用于进行基因研究、法医鉴定、疾病检测和药物筛选等。基因芯片技

术具有无可比拟的高效、快速和多参量特点,是在传统的生物技术如

检测、杂交、分型和DNA测序技术等方面的一次重大创新和飞跃。

二、基因芯片技术

生物芯片技术是于90年代初期随着人类基因组计划的顺利进行而

诞生,它是通过像集成电路制作过程中半导体光刻加工那样的微缩技

术,将现在生命科学研究中许多不连续的、离散的分析过程,如样品

制备、化学反应和定性、定量检测等手段集成于指甲盖大小的硅芯片

或玻璃芯片上,使这些分析过程连续化和微型化。也就是说将现在需

要几间实验室、检验室完成的技术,制作成具有不同用途的便携式生

化分析仪,使生物学分析过程全自动化,分析速度成千上万倍地提高,

所需样品及化学试剂成千上万倍地减少。可以预见,在不远的将来,

用它制作的微缩分析仪将广泛地应用于分子生物学、医学基础研究、

临床诊断治疗、新药开发、司法鉴定、食品卫生监督、生物武器战争

等领域。

生物芯片技术是目前应用前景最好的DNA分析技术之一,分析对

象可以是核酸、蛋白质、细胞、组织等。目前全世界用生物芯片进行

疾病诊断还处于研究阶段,国外已将其用于观察癌基因及肌萎缩等一

些遗传病基因的表达和突变情况。

生物芯片技术还可以用于治疗,例如已开发出在4平方毫米的芯

片上布满400根有药物的针,定时定量为病人进行药物注射。另外,

科学家还在考虑制作定时释放胰岛素治疗糖尿病的生物芯片微泵及可

以置入心脏的芯片起搏器等。生物芯片技术与组合化学相结合将开辟

另一个极有价值的应用方向,即为新药研制提供超高通量筛选平台技

术,这必将使新药研究开发和传统中药的成分评估获得重大突破。

三、基因芯片的应用技术举例

1、基因破译

目前,由多国科学家参与的“人类基因组计划”,正力图在21世

纪初绘制出完整的人类染色体排列图。众所周知,染色体是DNA的载

体,基因是DNA上有遗传效应的片段,构成DNA的基本单位是四种

碱基。由于每个人拥有30亿对碱基,破译所有DNA的碱基排列顺序

无疑是一项巨型工程。与传统基因序列测定技术相比,基因芯片破译

人类基因组和检测基因突变的速度要快数千倍。

基因芯片的检测速度之所以这么快,主要是因为基因芯片上有成

千上万个微凝胶,可进行并行检测;同时,由于微凝胶是三维立体的,

它相当于提供了一个三维检测平台,能固定住蛋白质和DNA并进行分

析。

美国正在对基因芯片进行研究,已开发出能快速解读基因密码的

“基因芯片”,使解读人类基因的速度比目前高1000倍。图1所示为

一种内嵌基因芯片的基因检测装置。

2、基因诊断

通过使用基因芯片分析人类基因组,可找出致病的遗传基因。癌

症、糖尿病等,都是遗传基因缺陷引起的疾病。医学和生物学研究人

员将能在数秒钟内鉴定出最终会导致癌症等的突变基因。借助一小滴

测试液,医生们能预测药物对病人的功

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