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水生动物细菌性病原检测技术规范
1范围
本标准规定了水生动物细菌性病原(Bacterialpathogensofaquaticanimals)检测的试剂与材料、仪器设备、采样、细菌性病原分离培养和病原菌检测。
本标准适用于山东省水生动物常见细菌性病原检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB4789.28食品安全国家标准食品微生物学检验培养基和试剂的质量要求SC/T7014—2006水生动物检疫实验技术规范
SC/T7201.1鱼类细菌病检疫技术规程第1部分:通用技术
SN/T2123出入境动物检疫实验样品采集、运输和保存规范
3试剂与材料
试剂与材料应符合GB4789.28和附录A的规定。
4仪器设备
按照SC/T7201.1的规定执行。
5采样
5.1采样用具
应使用无菌采样用具。
5.2采样数量、个体要求、采集部位
按照SC/T7014—2006中第6章的规定执行。
5.3样品运输及保存
按照SN/T2123的规定执行。
6细菌性病原分离培养
6.1分离培养
2
6.1.1兼性厌氧菌和需氧菌的分离培养
规范取样后,采用稀释倒平板法、涂布平板法、平板划线法等方式,在28℃~30℃培养24h;低温下取样应在15℃~18℃同步培养24h。
6.1.2厌氧菌的分离培养
将处理好的平板置于玻璃干燥器,并在其上方放置连二亚硫酸钠和无水碳酸钠(分别研细均匀,临用前混合置于一平皿内)各30g/1000mL容积,然后将干燥器盖严,用凡士林密封,在28℃~30℃培养24h;低温下取样则应在15℃~18℃同步培养24h。
严格厌氧菌的分离培养应在厌氧工作台中进行。
6.2纯培养
6.2.1兼性厌氧菌和需氧菌的纯培养
挑取单菌落,接种于相应培养基上,按照6.1.1的方法培养。
6.2.2厌氧菌的纯培养
挑取单菌落,接种于相应培养基上,按照6.1.2的方法培养。
6.3多次纯培养
若经过纯培养后,未能得到形态特征基本一致的单菌落,可进行多次纯培养,直到获得形态特征基本一致的单菌落,操作步骤应符合6.2的要求。
7病原菌检测
7.1病原菌16SrDNA序列分析
7.1.1菌落PCR
按照附录B执行。
7.1.2结果判定
7.1.2.1PCR结果可靠
DNAMarker标准样品出现清晰的梯度条带,阳性对照可见1472bp左右DNA条带,且阴性和空白对照样品无条带出现,则PCR实验结果可靠,可进行样品分析。
7.1.2.2电泳失败
DNAMarker标准样品未出现条带,则电泳失败,应检查电泳试剂重新进行电泳。
7.1.2.3检测结果无效
DNAMarker标准样品出现清晰的梯度条带,阳性对照无条带或者DNA条带非1472bp左右,或者在阴性对照和空白对照样品中出现了DNA条带,则试验结果无效,应重新进行PCR扩增。
7.1.3克隆、测序和比对
3
将7.1.2样品扩增条带克隆、测序,序列输入到NCBI网站进行比对,确定细菌的属种。
7.2病原菌生化特性检测
按照SC/T7014—2006中的9.4规定执行。
7.3结果综合判定
需要鉴定病原菌到属依据7.1.3结果进行判定,需要进一步鉴定到种应结合7.2结果进行综合判定。
4
附录A
(规范性附录)
试剂的配制
A.1TE缓冲液
A.1.1A液:1mol/LTris·HCl(pH8.0)
称取Tris碱6.06g,加去离子水40mL溶解,滴加浓HCl约2mL调pH至8.0,定容至50mL。
A.1.2B液:0.5mol/LEDTA(pH8.0)
称取Na2EDTA·2H2O9.31g,加超纯水35mL,剧烈搅拌,用约1gNaOH颗粒调pH至8.0,定容至50mL(Na2EDTA·2H2O需加入NaOH将pH调至接近8.0时才会溶解)。
A.1.3TE缓冲液
量取A液5mL,B液1mL于烧杯中,加400mL去离子水混合,调pH至8.0,定容至500mL。
A.21×TAE缓冲液
称取Tris242.0g,Na2EDTA·2H2O37.2g于1L烧杯中,加800mL去离子水充分搅拌溶解,再加入57.1mL醋酸,充分混匀。最后以去离子水定容至1000mL即为50×TAE缓冲液,使用时稀释50倍即可。
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附录
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