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MiseqSystem文库变性和稀释指南
摘要
本指南介绍了对Tumina@MiSeq@system上进行测序的文库进行变性和稀释方法,同时介绍了用作测
序控制PhiX文库的制备说明。
耗材和设备
耗材
和名称供应商
HTI(HybridizationBuffen,thawedandprechilledIUumina提供的MiSeqReagentKit
TuminaPhiXControl,Catalog#FC-110-3001liumina(选择)
1.0NNaOH,molecularbiology-grade一般实验窜供应商
Tris-Cl10mM,PH8.5with0.19%Tween20一般实验宣供应商
设备
名称供应商
本_SciGene,catalog#1057-30-O(115Vj,orequivalent
hybex微型鲜化器(HybexMicrosampleIncubator)
SciGene,catalog#1057-30-2(230Y),orequivyalent
].5ml的离心管SciGene,catalog#1057-34-0,orequivalent
下
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警拟级夭。
所”开天酉基朋成才谋取考的六访,将从痢PNiX局落总访太内于与灾树误厌胡同的汽居。
工试剂准备
11准备新鲜稀释的NaOH
妨取8$00hLaberatory-gradewater至1.5ml微量离心管小
信添加200hL的1ONNaOH,获得Iml含02NNaOH溶液
令征倒1.5ml的离心管数次泥匀
二注:
w始终准备新鲜稀释的NaOH用十变性文库以便簇牛成。
w”为防止小的移液误差影响最终的NaOH浓度,准备全少1ml新鲜稀释的NaOH。
w”为获得最佳结果,请在变性和稀释文库之前解冻测序试剂。参考MiSeqSystemUserGuide(part
#
12准备HT1
心将-25C一-155C储存的HTI移全室温溶解
妨待HTI溶解打储存至2C一8eC冰箱中备用
1.3稀释变性PhiX质控
名称最终PhiX浓度
MiSeqReagentKitv3将变性PhiX对蜡稀释至20pM,对于v3试剂能够产生最住钱密度
MiSeqReagentKity2将变性PhiX对照稀释至12.5pM,对-]v2试剂能够产生最件艇密度
1.3.1称释PhiX文库至4nM
仿取2h170nwfP光文库至1.5ml的微量离心管中
仿添310Tris-CHPH8SwiD19%Tveen20
13.2变性4nMPbiX文库
妨向上述淮备好的4nMPhiX文库中加入5hl已准备好的D2NNaOH
仿知暂流涡混匀后280xg离心Imin
令室温孵育Smin
仿添加990呈准备好的HTI,获得Iml含20pM变性的Ph
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