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手把手教你荧光定量PCR(一)

之前医学方小编教过大家如何在线利用NCBIprimerblast设计荧

光定量PCR引物,那么当我们有了引物,如何利用荧光定量PCR实验

来检测mRNA水平呢?今天小编先教给大家Real—timePCR最重要

的第一步,如何抽提高质量的RNA?

首先简单介绍一下实验中所用化学试剂耗材清单和作用,做到实

验时心中有数。

实验材料

Trizol

氯仿

异丙醇

无水乙醇

DEPC水(焦磷酸二乙酯)

Randomprimer

逆转录酶(AMV)及其buffer

RNaseinhibitor

新的没有用过的枪头

384孔板(透明)

DVD光盘(刻录拷贝数据)

八连PCR管

SYBRMasterMix

实验试剂作用

01

Trizol主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,则其主要作用是裂解细胞、

抑制RNAse活性和蛋白质变性

2

氯仿作用(1)变性蛋白,(2)抽取苯酚,促进水相和有机相分

离;(3)去除脂溶性物质如油脂。配合的异戊醇的作用是消泡。

三层:上清RNA苯酚氯仿DNA下层蛋白质

3

异丙醇作用:破坏核酸的氢键而促进其从水相中沉淀,配合使用

的醋酸铵等盐则中和核酸负电荷,加速核酸聚积沉淀。

4

75%乙醇的作用是去除异丙醇和其它盐分。

5

DEPC水(焦磷酸二乙酯)是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。

它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而

抑制酶的活性。

RNA抽提步骤

在所有RNA实验中,最关键的因素是得到全长的RNA。实验失

败的主要原因是RNA酶的污染。RNA酶可耐受多种处理而不被灭活,

如煮沸、高压灭菌等。RNA酶最主要的潜在污染源是研究人员的手。

因此操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。

设置RNA操作专用实验室,所有器械等应为专用。

低温下操作

第一步:抽提RNA

1

最大起始量107个细胞,六孔板每孔加入Trizol1ml,充分混匀

裂解细胞,吹打至无粘稠(室温静置15min充分裂解)。

2

混匀,加入267ul氯仿(按照氯仿与Trizol体积比

200ul/0.75ml),充分震荡混匀,冰上3min。

3

12000g,15min,4℃。

4

小心吸取上清水相至新的Ep管中(约500ul),用200ul枪头吸

出(千万不要吸入中间界面酚氯仿层)。

5

加入500ul(终浓度50%)异丙醇沉淀RNA,室温静置30min,或

充分沉降-20度过夜。

6

15000g,15min,4℃。

7

此时可看到管底白色沉淀,即为RNA,小心弃掉上清,加入

1ml75%乙醇(无水乙醇和DEPC水配置),洗涤沉淀RNA。

8

12000g,1min,4℃。

9

弃掉75%乙醇,重复洗一次后,空离十几秒,在超净台内将剩余

液体吸干(大枪头套小枪头),并置于超净台内风干。

10

根据RNA量,加入15-30ulDEPC水,吹打将RNA沉淀悬浮混匀。

11

3

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