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外泌体的鉴定宝典
外泌体参与神经疾病和癌症等很多种疾病的病理过程,同时在正
常的生理过程中也发挥着介导细胞间通讯的重要功能。细胞外囊泡在
临床医学中也有十分光明的应用前景,由于它们含有丰富的生物标志
物,可用于监测疾病进展,治疗反应等,同时由于外泌体具有携带递
送生物分子的功能,具有成为临床药物递送载体的潜力。外泌体的功
能研究第一步,即进行外泌体的鉴定。
鉴定外泌体首先需要通过WB来鉴定外泌体的标志蛋白是否存在
于样品中,通过电子显微镜来观察样品中细胞外囊泡的形态特征以及
直径,对其进行区分鉴定。
1WB验证:检测外泌体标志蛋白的表达情况
外泌体形成于早期胞内体,在内吞体转运复合体(ESCRT)及一
些相关蛋白的调控下,早期胞内体发生内出芽形成多个腔内小囊泡,
构成多胞体(MVB),MVB最后在GTPase家族中的RAB酶调解下
与细胞膜融合向外界释放囊泡。
wode
外泌体膜上富含参与外泌体运输的四跨膜蛋白家族(CD63、
CD81和CD9))、热休克蛋白家族((HSP60、HSP70、HSPA5、
CCT2和HSP90)以及一些细胞特异性的蛋白包括A33(结肠上皮细胞
来源)、MHC-II(抗原提呈细胞来源)、CD86(抗原提呈细胞来源)以及
乳凝集素(不成熟的树突状细胞)。其中CD63、CD9、CD81以及
TSG101、HSP70、ALIX等,是最常用到的细胞外囊泡标志物。
这些标志物蛋白其实主要是涉及到了囊泡的形成和分泌过程,他
们产生于细胞中,定位于胞内的膜结构附近,如四旋蛋白(CD9,
CD63和CD81),直接参与了细胞外囊泡内容物的分选;TSG101是
ESCRT复合体相关的蛋白,而ESCRT复合体是膜形成和断裂的驱动器。
ALIX直接涉及到了膜泡在形成过程中切割脱离质膜形成独立膜结构的
过程。
可选实验操作步骤:
(1)超离后获得外泌体,加入PBS重悬或者加入蛋白裂解液(若
外泌体量小,加入裂解液后可省略离心取上清步骤)。
(2)对外泌体以及对照细胞裂解样品进行蛋白BSA定量。
(3)向每个管中加入5xSDS样品缓冲液,稀释至1X。
(4)95℃加热5分钟,使蛋白变性。
(5)将样品5-10ug样品进行上样,选用10%或12%的凝胶进
行电泳,检测标志蛋白。
在进行WB验证时,最好也选择一些外泌体没有而细胞总蛋白才
有的标志蛋白,如GRP94,EEA1,GM130,PMP70等。
2电镜:分析外泌体的大小/形态等。
若更确切的去鉴定外泌体,则需要通过外泌体免疫胶体金电镜来
观察蛋白质在外泌体中的位置。
现代先进的扫描电镜的分辨率已经达到1nm左右,足够用来进行
外泌体尺寸的测量,在外泌体研究中,能够直接观察到样品中外泌体
的形态。
可选实验操作步骤:
(1)超离后获得外泌体,加入2%戊二醛,4℃固定。
(2)磷酸缓冲溶液漂洗4次,每次15分钟。
(3)1%四氧化锇将样品后固定2小时
(4)ddH2O漂洗两次,每次10分钟。
(5)2%碳酸铀水溶液染色2小时。
(6)脱水:50%乙醇溶液-70%乙醇溶液-90%乙醇溶液-100%
乙醇溶液-100%丙酮1-100%丙酮2,4℃孵育15分钟。
(7)渗透:并加入1:1丙酮:包埋剂,室温孵育2小时。然后
加入纯包埋剂,室温孵育过夜。
(8)使用包埋模具进行包埋。
(9)聚合:37℃恒温箱12小时-45℃恒温箱12小时-60℃下烘
烤48小时。
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