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碱裂法1完整版本.docxVIP

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碱裂解法质粒抽提

溶液I:50mM葡萄糖/悬浮大肠杆菌

25mMTris-Cl/抑制DNase的活性,和抑制微生物生长

10mMEDTA/螯合二价金属离子

pH8.0;

溶液II:0.2MNaOH和1%SDS,等体积混合/破碎细胞

溶液III:3M醋酸钾,2M醋酸/中和

步骤:

1, 收集菌液。离心,12,000rpm×2mim;

2, 再悬浮。溶液I,200ul悬浮。菌体一定要悬浮均匀,不能有结块。

3, 裂解。溶液II,现配,200ul。上下颠倒混匀,切勿剧烈震荡;

第一, 时间不能过长,冰上2min。防止在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂;

第二,必须温柔混合,防止基因组DNA断裂。

4, 中和。溶液III,200ul。冰上5min;

5, 离心12,000rpm×10mim,取上清,氯仿抽提;

6, 加入1:1体积的异丙醇,离心后70%乙醇洗一次,晾干,30-50ulRnaseA(0.5%)无菌水溶解。

7, 电泳:三条带,

超螺旋、开环和复制中间体(即没有复制完全的两个质粒连在了一起)。如果你不小心在溶液II加入后过度振荡,会有第四条带,这条带泳动得较慢,远离这三条带,是20-100kb的大肠杆菌基因组DNA的片断。

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