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老当益壮,宁移白首之心;穷且益坚,不坠青云之志。——唐·王勃

COVID-19的病毒学、流行病学以及发病机制的认识

新兴严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)疾病在中国的爆

发(COVID-19)已引起全球关注,并在2020年3月11日被世界卫生组织(WHO)

宣布为大流行病。由于没有特定的疗法和疫苗可用于疾病控制,COVID-19的流

行对全球公众的健康构成了巨大威胁。

2019年年底,湖北省武汉市出现了一群原因不明确的肺炎患者,随后,由

于春节将近,人口流动大,疾病在在全国范围内蔓延传染,截止到2020年6月

2日24时,我国已有84602例确诊病例。通过序列分析,人们认为这种肺炎是

由一种新的冠状病毒2019-nCoV引起的,后来WHO在2020年2月11日又将其

命名为2019冠状病毒病CoronavirusDisease-2019(COVID-19),在同一天,国际

病毒分类学委员会(ICTV)将这种新型冠状病毒命名为SARS-CoV-2。至今,

SARS-CoV-2感染仍在蔓延,涉及欧洲、非洲、美洲和大洋洲等地,这种病毒对

全世界人民的健康构成了严重威胁。中国大陆几乎所有省份都确认颁布了联合的

预防和检疫机制,及时控制住了疫情。但由于缺乏特定的抗病毒治疗方法和临床

治疗,全世界每天有数千例严重病例死亡。

一、病毒学

1.起源

在2019年底,湖北省武汉市的几家当地医院出现了COVID-19,根据临床

表现,血液检查和胸部X光片检查,该疾病被临床医生诊断为病毒引起的肺炎。

初步的流行病学调查建议大部分疑似病例与他们在华南的存在的海鲜市场有关。

这个海鲜市场,不仅出售海鲜,而且还出售许多野生动物。中国疾病预防控制中

心(CDC)从华南海鲜市场的环境样品中分离出SARS-CoV-2,这意味着爆发的

起源。但是,这样的结论是有争议的,因为最早的病例与海鲜市场没有关联。另

外,官方在COVID-19报道的几个月前就发现了至少两种不同的SARS-CoV-2

病毒株。最近流行病学分析表明,华南海鲜市场的SARS-CoV-2可能是来源于从

其他国家进口的地方。所以COVID-19的起源到目前还是一个争议,需要确切的

证据来解释这个问题。

2.分类及其亚型

老当益壮,宁移白首之心;穷且益坚,不坠青云之志。——唐·王勃

分离出的SARS-CoV-2,经过序列和进化树分析,被认为是β-CoV的成员。

1975年,国际病毒命名委员会正式命名了冠状病毒科,冠状病毒科又分为两个

亚科:Letovirinae亚科和正冠状病毒亚科,而正冠状病毒亚科又下分为α、β、

γ和δ四个属。CoVs家族是一类包膜的,单股正链RNA病毒。其遗传物质是

所有RNA病毒中最大的,只感染人、鼠、猪、猫、犬、禽类脊椎动物。这种病

毒可引起呼吸道,肠道,肝脏和神经系统疾病。其中,α和β属涉及人类、家畜

和宠物等,病毒种类较多,γ和δ属多是禽类冠状病毒,种类较少。国际病毒分

类委员会2018年已鉴定的人和动物冠状病毒共有23个亚属38个种。虽然有多

达38种,但是其中目前已知可感染人类的冠状病毒仅6种—HCoV-229E、

HCoV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV。到目前,

加上现在的2019-nCoV,一共是7种。SARS冠状病毒(SARS-CoV)和MERS

冠状病毒(MERS-CoV)是β-CoV的成员。全基因组系统发育树分析表示

SARS

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