高脂饲喂对肉鸡腹脂和肝脏组织RNA_可变剪接的影响 .pdfVIP

广东农业科学GuangdongAgriculturalSciences2024，51（2）：112-123DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2024.02.011

敖广宇，陈庚华，夏燚琳，罗文.高脂饲喂对肉鸡腹脂和肝脏组织RNA可变剪接的影响［J］.广东农业科学，2024，51（2）：112-123

GuangdongAgriculturalSciences,2024，51（2）：112-123.

高脂饲喂对肉鸡腹脂和肝脏组织

RNA可变剪接的影响

敖广宇，陈庚华，夏燚琳，罗文

（华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室/

农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室，广东广州510642）

摘要：【目的】腹脂过度沉积会降低肉鸡抗病力和屠宰率。RNA可变剪接是影响基因功能的重要调控方式，

对肉鸡腹脂沉积过程的RNA可变剪接事件进行系统分析，有助于进一步了解肉鸡腹脂沉积的分子调控机理。【方

法】利用高脂饲喂肉鸡和普通饲喂肉鸡肝脏组织和腹脂组织的转录组测序结果，鉴定高脂饲喂过程中肉鸡腹脂和肝

脏组织的差异表达和差异剪接基因。采用GO功能注释、KEGG通路富集分析和Metascape富集分析对显著差异剪

接基因进行分析，并对显著差异剪接事件进行可视化处理，以及分析调控这些差异剪接事件的剪接因子。【结果】

对高脂饲喂肉鸡与普通饲喂肉鸡的腹脂和肝脏组织进行转录组测序，在腹脂组织中发现233个显著差异表达基因和

349个显著差异剪接基因，对显著差异剪接基因进行富集分析，发现显著差异剪接基因主要富集于细胞分裂、细胞

生长等细胞增殖相关生物学进程，还富集于甘油磷脂代谢和胰岛素信号通路等脂肪生成相关通路。在肝脏组织中发

现276个显著差异表达基因和224个显著差异剪接基因，对显著差异剪接基因进行富集分析，发现显著差异剪接基

因主要富集于蛋白质乙酰化、蛋白质内部氨基酸乙酰化和mRNA加工等细胞代谢相关生物进程，还富集于胰岛素

信号通路、胰高血糖素信号通路、AMPK信号通路等脂肪生成相关通路。在腹脂和肝脏的显著差异剪接基因中，共

筛选到影响肉鸡腹脂沉积性状的相关候选基因4个，包括GPAT4、RELCH、CYP39A1和PPARA。【结论】研究结

果初步揭示高脂饲喂下肉鸡腹脂和肝脏组织的RNA可变剪接调控规律。推断高脂饲喂可能通过影响基因可变剪接

过程，进而激活前脂肪细胞的增殖和脂肪生成相关细胞代谢，从而导致肉鸡的腹脂沉积现象；剪接因子对靶基因的

调控显著参与影响肉鸡的腹脂沉积过程。

关键字：杏花鸡；高脂饲料；腹脂沉积；转录组；可变剪接；差异表达基因

中图分类号：S831.2文献标志码：A文章编号：1004-874X（2024）02-0112-12

EffectsofHigh-fatDietonAlternativeSplicingofRNAin

AbdominalFatandLiverTissuesofBroilers

AOGuangyu,CHENGenghua,XIAYilin,LUOWen

（CollegeofAnimalScience,SouthChinaAgriculturalUniversity/GuangdongKeyLaboratoryof

AgriculturalAnimalGenomicsandMolecularBreeding/KeyLaboratoryofChickenGenetics,Breedingand

Reproduction,MinistryofAgricultureandRuralAffairs,Guangzhou510642,China）

Abstract:

收稿日期：2023