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非淡泊无以明志,非宁静无以致远。——诸葛亮
前言
中心法则:
非淡泊无以明志,非宁静无以致远。——诸葛亮
第一章PCR
一、概念:
PCR(聚合酶链式反应,PolymeraseChainReaction)是利用DNA在体外摄氏
95°高温时变性会变成单链,低温(经常是60°C左右)时引物与单链按碱基互补
配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72°C左右),DNA聚
合酶沿着磷酸到五碳糖(5-3)的方向合成互补链。
二、原理:
DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作
用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复
制成同样的两分子挎贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,
当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复
性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序
列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至95℃左右一定时间后,使模板DNA
双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,
为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性
成单链后,温度降至60℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③
引物的延伸:DNA模板--引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合
酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对原则与半
保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链,重复循环变
性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为
下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因
扩增放大几百万倍。
非淡泊无以明志,非宁静无以致远。——诸葛亮
三、引物
PCR反应中有两条引物,即5′引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链
为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA
序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。
引物设计的基本原则
①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右,Tm值在60℃比较好。
②引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易
出现非特异条带。
常用引物设计软件有:PrimerPremier5.0、VectorNTISuit、DNAstar等
Tm值:
Tm值就是DNA熔解温度,指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。不
同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。
Tm计算公式为:Tm=4℃(G+C)+2℃(A+T)
四、示意过程:
例如:TaqPlusDNAPolymerase(P201)
反应体系:
DDW
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