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山东师范大学硕士学位论文
目录
摘要I
AbstractIII
第一章绪论1
1.1DNA研究概述1
1.2天然修饰的DNA碱基与加合物2
1.3人工修饰的荧光碱基类似物4
1.4光化学反应5
1.5荧光标记技术在DNA研究中的应用7
第二章计算方法与理论基础9
2.1密度泛函理论10
2.1.1Thomas-Fermi模型10
2.1.2Hohenberg-Kohn定理12
2.1.3Kohn-Sham方程13
2.2含时密度泛函理论14
TESICT2-(Z)17
第三章荧光碱基类似物基于机制选择性识别氨基腺嘌呤的理论研究
3.1引言17
3.2计算方法18
3.3结果与讨论18
3.3.1碱基单体的光物理性质19
3.3.2荧光类似物T-R1和T-R1(S)选择性识别Z碱基21
3.3.3与脱氧核糖连接后对光谱性质的影响23
3.4本章小结25
附录27
第四章荧光胞嘧啶类似物基于激发态电荷转移机制实时检测G-AF加合物的理论研究..35
4.1引言35
山东师范大学硕士学位论文
4.2计算方法36
4.3结果与讨论37
4.3.1碱基单体的光物理性质37
4.3.2碱基配对效应对光谱特性的影响39
4.3.3与脱氧核糖连接后对光谱性质的影响40
4.4本章小结42
附录43
第五章总结与展望47
5.1本文研究内容总结47
5.2创新点47
5.3工作展望48
参考文献49
致谢63
攻读硕士学位期间发表的学术论文65
山东师范大学硕士学位论文
摘要
(DNA)(A)
脱氧核糖核酸是生物主要的遗传物质,其包含的四种含氮碱基腺嘌呤、鸟嘌
呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)在遗传信息的传递中起着主导作用。然而,天然碱基在生
命系统中会受到各种化学修饰,从而形成多样的非常态碱基。非常态碱基不仅在正常生命
过程中起着重要的作用,而且会导致多种疾病的发生。因此,有效探测非常态碱基对深入
理解相关过程及发展新型治疗方案等方面具有重要的意义。基于此,本文设计了一系列同
构或扩环荧光碱基类似物,并运用量化计算对荧光碱基类似物单体及其与非常态碱基配对
后的光谱性质进行理论研究,同时考察生物环境如连接脱氧核糖对体系光谱性质的影响。
具体内容如下:
1、荧光T碱基类似物基于ESICT机制选择性识别2-氨基腺嘌呤(Z)的理论研究
2-(Z)S-2L
氨基腺嘌呤是一种特殊的修饰碱基,其最早从噬菌体中被发现,此
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