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安徽农业科学,JournaolfAnhuiAsr.Scii.2007。35(2):378—379责任编辑姜丽责任校对胡剑胜
比较蛋白质组学研究技术进展及其在营养代谢病研究中的应用前景
郝贵增I徐闯2t(1.安阳工学院。河南安阳455ooo;2.吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春l3oo62)
摘要对经典的比较蛋白质组学研究通路所涉厦的各个技术环节的研究进展、改进、提高进行了综述,最后阐述比较蛋白质组学在
营养代谢病研究中的应用前景。
关键词比较蛋白质组学;营养代谢病
中图分类号Q51文献标识码A文章编号0517—6611(2007)02—00378-02
随着多种生物基因组测序计划的完成,应用蛋白质组白质分子量不同进行SDS一聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—
学手段在整体水平上研究复杂生命现象的后基因组时代已PAGE)。2DGE完整分离蛋白质的容量和效率是其他方法无
经到来。差异蛋白质组学作为蛋白质组学研究的重要组成法比拟的。蛋白质翻译后的磷酸化、糖基化等修饰,由于改
部分,其着重比较研究不同生物体在不同时刻或状态下蛋变了蛋白质的分子量或等电点,同样可以在2DGE上分辨。
白质表达的变化情况,已广泛应用于各种研究中。经典的比正是由于2DCE的诸多优点,使它成为比较蛋白质组学研
较蛋白质组学研究技术通路是:样品制备一2D电泳一质究的主要技术。
谱一生物信息学。近些年对2DGE的研究,使其不足有所完善。第l,固相
差异蛋白质组学研究具有其独特的优势:①差异蛋白pH值梯度等电聚焦电泳(IPG)的应用,大大提高了2DGE
质组学的研究在技术上有更高的可实现性,目前的研究技的分辨率、重复性及减少了碱性漂移现象。第2,对于极酸
术还不可能把细胞内所有的蛋白质展现出来Ⅲ;②差异蛋白极碱性蛋白质的分析,研究者采用多块窄pH值梯度的凝
质组学反映了蛋白质的动态本质闭;③差异蛋白质组学具有胶电泳,如pH值为10~l2的IPG胶条,用更大的分辨率覆
广泛和明确的应用前景,如疾病生物标记物的研究等13]。近盖更大的pH范围。第3,为解决疏水性蛋白质或高不溶性
些年,比较蛋白质组学研究技术进一步得到完善。笔者对比蛋白质的溶解问题,最近将一些有效离液剂(如硫脲),表面
较蛋白质组学研究经典通路所涉及的各个技术环节的研究活性剂(如SB3一l、ABC14、C8),还原剂磷酸三丁酯(TBP)等
进展进行了综述,最后阐述了比较蛋白质组学在营养代谢引入样品提取液及裂解液中,再加上顺序提取法,大大改善
病研究中的应用前景。了一些高不溶性蛋白质(如膜蛋白、结构蛋白质等)的抽提
1比较蛋白质学研究技术进展和在2DGE中的展现6【。I第4,为提高比较蛋白质组学检测的
1.1蛋白质样品制备研究进展样品制备是将比较样品灵敏度、准确性,改善低丰度蛋白质的检测,研究者采取一
分别进行蛋白质分离提取,去除其内的非蛋白成分,最大可系列方法:①在凝胶染色方面,通常采用考马斯亮蓝和银
能地提取全部蛋白质。对于其中一些微溶或疏水的蛋白质,染,为提高检测灵敏度,研究者采用荧光双向差异凝胶电泳
可采用不同的缓冲液进行逐步提取;样品制备的最终目标(DIGE),在2DE的基础上结合DIGE技术。将待比较的蛋
在于尽可能地扩大样品中蛋白质的溶解和解聚,减少样品白质样品经不同的荧光染料CYPRORuby(Cy2、Cy3、Cy5)
制备过程中蛋白质的降解。激光捕获微切割
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