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染色体嵌合体的产前遗传学诊断与遗传咨询.docxVIP

染色体嵌合体的产前遗传学诊断与遗传咨询.docx

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1

染色体嵌合体的产前遗传学诊断与遗传咨询

1范围

本标准旨在规定产前遗传学诊断中染色体嵌合体的定义、分类、检测技术、诊断原则、预后和再发风险评估。本标准仅就染色体嵌合体的产前诊断与遗传咨询进行详细讨论,其余变异类型嵌合体如拷贝数变异、单核苷酸变异/小片段缺失插入等嵌合体不在本标准正文讨论范围内,相关内容可参见附件1。

本标准适用于开展产前诊断技术服务的医疗机构,应用细胞遗传学或分子遗传学技术进行产前诊断时,对检出的染色体嵌合体进行分析、判读、验证、评估及遗传咨询。其中,产前遗传咨询意见需在开展产前诊断技术服务的医疗机构由产前咨询医师和遗传咨询师共同出具和执行。

2规范性引用文件

下列文件对本文件的制订是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T29859-2013生物信息学术语

GB/T34798-2017核酸数据库序列格式规范

T/GDPMAA0004-2020基于孕妇外周血浆游离DNA高通量测序无创产前筛查胎儿基因组病技术标准

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1

同源嵌合体mosaicism

一个个体或一种组织中,含有源于单个受精卵但遗传组成不一致的两种或以上细胞系的现象。一般而言,其遗传组成不一致仅限于特定基因位点、基因组片段或染色体。

3.2

异源嵌合体chimerism

来源于不同受精卵的两种或两种以上遗传组成不一致的细胞系存在于同一个体或一种组织中的现象。一般而言,其遗传组成不一致遍布整个基因组。

3.3

生殖腺嵌合体germlinemosaicism

嵌合体只局限于生殖腺细胞,不存在于其它体细胞中。

3.4

体细胞嵌合体somaticmosaicism

2

嵌合体存在于除生殖腺细胞以外的其它体细胞中。

3.5

体细胞-生殖腺嵌合体gonadosomaticmosaicism

嵌合体既存在于生殖腺细胞,也存在于其它体细胞中。

3.6

限制性胎盘嵌合体confinedplacentalmosaicism;CPM

嵌合体只局限于胎盘组织,不存在于胎儿或新生儿。

3.7

真性胎儿嵌合体truefetalmosaicism;TFM

嵌合体不仅存在于胎盘组织中,还存在于胎儿和新生儿中。

3.8

染色体异常chromosomeabnormality

体细胞或生殖细胞内染色体发生的异常改变,分为数目异常和结构异常两大类。染色体数目异常可分为整倍体异常和非整倍体异常;染色体结构异常可分为显微水平的缺失、重复、易位、倒位和插入等。

3.9

拷贝数变异copynumbervariant;CNV

由基因组重排形成的结构变异,一般指长度≥50bp的基因组片段拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复,是人类疾病的重要致病因素之一。

3.10

结构变异Structuralvariant;SV

≥50bp的基因组重排,既包括平衡型重排,如易位和倒位等,也包括非平衡型重排,如缺失、重复、新序列插入、移动元件插入等。

3.11

纯合区域regionsofhomozygosity;ROH

对于大部分的二倍体细胞如人类体细胞,拥有两份基因组,一份来自于父亲,另一份来自于母亲,在某一个碱基上,如果来自父本和母本的碱基不同时,则该位点为杂合(heterozygous)。如果因为某种机制(如远亲关系或近亲关系婚姻或基因转换)导致在一定范围内连续的等位基因序列都是纯合子而无杂合子(拷贝数仍为2个),则该区域为基因组纯合区域(regionsofhomozygosity,ROH)。

3

3.12

单亲二体uniparentaldisomy;UPD

指来自父母一方的染色体片段被另一方的同源部分取代,或一个个体的两条同源染色体都来自同一亲本。

3.13

染色体微阵列分析chromosomalmicroarrayanalysis;CMA

基于核酸分子杂交的原理,采用特异性寡核酸探针或单核苷酸多态性探针对全基因组进行杂交检测,以分析基因组CNV或ROH的一种检测技术。

3.14

CNV测序CNVsequencing;CNV-seq

基于高通量测序技术,对基因组进行低深度测序,结合生物信息学方法确定基因组CNV的方法,其对染色体微缺失、微重复有较高的分辨率,但不能检测染色体结构异常。

4缩略语

以下缩略语适用于本文件。

BPD——双亲二体(biparentaldisomy)

CMA——染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanalysis)

CNV——拷贝数变异

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