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操千曲尔后晓声,观千剑尔后识器。——刘勰
蓝白斑菌落pcr扩增DNA电泳实验报告
PCR扩增反应的操作实验报告
实验原理:
以单链DNA为模板,4种dNTP为底物,在模板3’末端有引物
存在的情况下,用酶进行互补链的延伸,多次反复的循环能使微量
的模板DNA得到极大程度的扩增。在微量离心管中,加入与待扩增
的DNA片段两端已知序列分别互补的两个引物、适量的缓冲液、微
量的DNA膜板、四种dNTP溶液、耐热TaqDNA聚合酶、Mg2+等。反
应时先将上述溶液加热,使模板DNA在高温下变性,双链解开为单
链状态;然后降低溶液温度,使合成引物在低温下与其靶序列配
对,形成部分双链,称为退火;再将温度升至合适温度,在TaqDNA
聚合酶的催化下,以dNTP为原料,引物沿5’→3’方向延伸,形
成新的DNA片段,该片段又可作为下一轮反应的模板,如此重复改
变温度,由高温变性、低温复性和适温延伸组成一个周期,反复循
环,使目的基因得以迅速扩增。因此PCR循环过程为三部分构成:
模板变性、引物退火、热稳定DNA聚合酶在适当温度下催化DNA链
延伸合成。
实验步骤:一、PCR反应的条件
PCR反应条件为温度、时间和循环次数。
1.温度与时间的设置
操千曲尔后晓声,观千剑尔后识器。——刘勰
(1)变性温度与时间:变性温度低,解链不完全是导致PCR失
败的最主要原因。
一般情况下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA变性,若低于
93℃则需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有
影响。此步若不能使靶基因模板或PCR产物完全变性,就会导致
PCR失败。
(2)退火(复性)温度与时间:退火温度是影响PCR特异性的
较重要因素。变性后温度快速冷却至40℃~60℃,可使引物和模板
发生结合。由于模板DNA比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞
结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。退火温度与时间,取决
于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长度。对于20
个核苷酸,G+C含量约50%的引物,55℃为选择最适退火温度的起点
较为理想。
(3)延伸温度与时间:TaqDNA聚合酶的生物学活性:70~
80℃,150核苷酸
/S/酶分子;70℃,60核苷酸/S/酶分子;55℃,24核苷酸/S/
酶分子;高于90℃时,DNA合成几乎不能进行。
(4)PCR反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,常用温度
为72℃,过高的延伸温度不利于引物和模板的结合。PCR延伸反应
的时间,可根据待扩增片段的长度而定,一般1kb以内的DNA片
段,延伸时间1min是足够的。3~4kb的靶序列需3~4min;扩增
操千曲尔后晓声,观千剑尔后识器。——刘勰
10kb需延伸至15min。延伸进间过长会导致非特异性扩增带的出
现。对低浓度模板的扩增,延伸时间要稍长些。
2.循环次数
循环次数决定PCR扩增程度。PCR循环次数主要取决于模板DNA
的浓度,一般的循环次数选在30~40次之间,循环次数越多,非特
异性产物的量亦随之增多。
二、PCR扩增产物分析
PCR产物是否为特异性扩增,其结果是否准确可靠,必须对其
进行严格的分析与鉴定,才能得出正确的结论。PC
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