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动物寄生虫病PCR诊断技术
聚合酶链反应(PolymeraseChainReaction,PCR)技术是一种既敏感又特异的DNA体外扩增
方法,它可将一小段目的DNA扩增上百万倍,其扩增效率使得该方法可检测到单个虫体或
仅部分虫体的微量DNA。通过设计种、株特异的引物,此法只扩增出种、株特异的PCR产
物,具有很高的特异性。而且PCR技术的操作过程也相对简便快捷,无需对病原进行分离
纯化;同时可以克服抗原和抗体持续存在的干扰,直接检测到病原体的DNA,既可用于虫
种、株的鉴别,动物寄生虫病的临床诊断,又可用于动物寄生虫病的分子流行病学调查。随
着PCR技术的不断完善与发展,它已广泛应用于分子生物学、生物技术、临床医学等各个
领域,具有广泛的应用前景。
一、实验目的要求
掌握PCR诊断技术所涉及实验的基本原理,全面熟悉PCR诊断技术的操作过程,其中包括
寄生虫DNA的提取、PCR引物的设计、PCR条件的优化、对目的片断的扩增、琼脂糖凝胶电
泳及结果分析、PCR产物的纯化等等。
二、实验仪器和材料
(一)寄生虫基因组DNA的提取及纯化
1.虫体材料。单个虫体。
2.器具。超净工作台、恒温培养箱、TGL-16G高速台式离心机、旋涡振荡器、微量取液器及
配套吸头、微量离心管、一次性注射器、微型眼科镊、微型眼科剪刀、玻璃平皿、滴管、有
机架等。
3.试剂。
(1)乙二胺四乙酸(Ethylenediaminetetraaceticacid,EDTA)、十二烷基磺酸钠(Sodium
dodecylsulfate,SDS)、三(羟甲基)氨基甲烷-盐酸(Tri(Hydroxymethyl)Aminomethane-HCl,
Tris-HCl)、氯化钠、蛋白酶K(25µg/µl)、异丙醇(80%)、双蒸水、灭菌超纯水等。
(2)DNA裂解液:500mMNaCl70µl、100mMTris-HCl(pH8.0)30µl、50mMEDTA(pH8.0)
150µl、10%SDS30µl。
(3)WizardTMDNAClean-Up试剂盒或类似的DNA提取试剂盒。
(二)PCR扩增及琼脂糖电泳
1.材料。提纯的虫体DNA。
2.器具。超净工作台、微型高速台式离心机、微量取液器(2/20/200/1000µl)、PCR扩增
仪、琼脂糖电泳系统、凝胶成像系统、微波炉、4℃/-20℃冰箱、紫外透射仪、微型离心管
(200/500/1500µl)、有机架、一次性手套、透明胶带、量筒(100ml)、三角瓶(500ml)
等。
3.试剂。
(1)10×PCRBuffer(无Mg2+)、dNTP(2.5mMeach)、ddH2O、MgCl2(25mM)、Primers、
ExTaq酶(5U/(l)、琼脂糖、EB(10mg/ml)、Tris碱、硼酸(Boricacid)、去离子水、EDTA
(0.5mol/L,pH8.0)、10×载样缓冲液。
(2)0.5×TBE缓冲液:准确秤取Tris碱5.4g,硼酸2.75g,充分溶解于800ml去离子水中,加
10ml0.5mol/LEDTA(pH8.0),用去离子水定容至1000ml。
(三)PCR扩增产物的纯化
1.材料。PCR扩增产物。
2.器具。TGL-16G高速台式离心机;三用电热恒温水箱;微量取液器(2/20/200/1000µl)、
琼脂糖电泳系统、微波炉、电子天平、4℃/-20℃冰箱、紫外透射仪、微型离心管(500/1500
µl)、有机架、透明胶带、一次性注射器、量筒(100ml)、三角瓶(500ml)、手术刀、保鲜
纸等。
3.试剂。琼脂糖;0.5×TBE缓冲液;UNIQ-10柱式DNA胶回收试剂盒;UNIQ-10柱式PCR
产物纯化试剂盒;异丙醇(80%)等。
三、实验方法、步骤和操作要领
(一)寄生虫基因组DNA的提取及纯化
1.实验原理。应根据研究目的来决定是从单个虫体还是多个虫体提取基因组DNA。寄生虫虫
体的各个部位都可以作为基因组DNA的抽提材料,如果虫体较大的话可取其中部而保存其
头部及尾部,以备形态学鉴定以验证其种类。如果虫体较小(小于1cm),则应使用整条虫
体抽取DNA。若虫体特别细小(例如幼虫),可用多条虫体来提取DNA。为了获得高含量、
高纯度的DNA,最好使用新鲜材料。从冻干或50%-70%乙醇保存的寄生虫材
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