《2024年基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因完整版727618525.pdfVIP

《基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关

功能基因》篇一

一、引言

在畜牧业中，鸡的热应激是一个常见的环境应激反应。北京

油鸡和广明白鸡作为中国传统的鸡种，在养殖过程中可能会遭遇

不同程度的热应激影响。而抗热应激的能力，不仅影响着鸡只的

生长速度、繁殖能力以及产品质量，还是保障其生存和经济效益

的重要因素。随着生物技术的发展，功能基因研究已成为家禽科

学研究的热点领域。其中，通过脾脏转录组的研究可以挖掘与热

应激相关的基因信息，有助于选育具有较强抗热应激能力的品种，

以提升养殖业的经济效益和产品质量。

二、材料与方法

1.实验材料

选取健康、体重相近的北京油鸡和广明白鸡各30只，分别饲

养于不同的环境条件下（如高温高湿环境），以模拟热应激状态。

2.实验方法

（1）样本采集：在热应激条件下，分别采集北京油鸡和广明

白鸡的脾脏样本，以确保获取充足的基因表达信息。

（2）RNA提取及测序：采用TRIzol法提取样本总RNA，利

用mRNA纯化及建库方法构建文库。接着使用IlluminaHiSeq测

序平台进行测序，得到两鸡种的脾脏转录组数据。

（3）数据筛选与分析：利用生物信息学方法对测序数据进行

筛选和过滤，并进行转录组注释。采用DESeq软件进行差异基因

分析，获取两组间的差异表达基因（DEGs）。最后，进行KEGG

和GO等功能分析，寻找与热应激相关的基因和生物功能模块。

（4）验证方法：选取关键差异基因，采用荧光定量PCR或

免疫组化等实验技术对相关功能基因的表达进行验证。

三、结果与分析

1.差异表达基因的筛选与鉴定

通过对北京油鸡和广明白鸡的脾脏转录组数据进行分析，共

筛选出数百个差异表达基因（DEGs）。其中，部分基因在两鸡种

中表现出明显的上调或下调趋势。这些基因主要涉及免疫、代谢、

能量平衡等生物过程。

2.抗热应激相关功能基因的挖掘

通过KEGG和GO等功能分析，发现部分差异表达基因与热

应激相关功能模块有关。例如，某些基因参与了抗氧化、能量代

谢、免疫调节等过程，这些过程在热应激条件下对鸡只的生存和

健康至关重要。此外，还发现部分基因与鸡只的抗病能力、生长

速度等性状有关。

3.验证结果

通过荧光定量PCR或免疫组化等实验技术对部分关键差异基

因进行验证，发现这些基因在两鸡种中的表达水平与转录组数据

相一致。这进一步证实了这些基因在抗热应激过程中的重要作用。

四、讨论与结论

本研究通过脾脏转录组的分析方法成功挖掘了北京油鸡和广

明白鸡抗热应激相关的功能基因。这些基因参与了多种生物学过

程，包括免疫反应、能量代谢和抗氧化等，有助于鸡只抵抗环境

变化所带来的应激压力。其中，部分基因具有明显的差异性表达

模式，可能成为选育抗热应激能力强、生长速度快等优良性状的

候选基因。此外，本研究还为进一步研究鸡只抗热应激的分子机

制提供了重要的参考信息。

总之，本研究基于脾脏转录组筛选了北京油鸡和广明白鸡抗

热应激相关功能基因，为选育抗热应激能力强、适应环境变化的

优质品种提供了理论依据和实践指导。然而，本研究仍存在一定

的局限性，如样本数量较小、实验条件尚需完善等。未来研究可

进一步扩大样本规模、优化实验条件和方法以提高研究结果的准

确性和可靠性。同时，可结合其他生物学技术手段如蛋白质组学、

代谢组学等对相关功能基因进行深入研究，为家禽养殖业的发展

提供更多有价值的科学依据。