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如何用Origin拟合标准曲线并计算IC50?
在之前的日志中讲了一下IC50的定义,也从网上找了个IC50计算器让大家使用。
但实际上在计算IC50的同时,我们一般也要标准曲线,还要线性方程。所以还是用Origin来拟合标准曲线,然后用origin内置功能来计算IC50比较方便。
这里使用Origin7.5来作演示。
1.先随意输入一组数据吧
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2.选中这2列数据,然后点左下角的作scatter图的图标,
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3.然后就生成了散点图
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4.点击Analysis菜单中的FitPolynomial,在弹出的对话框中,Order处设为1,这样就是作线性拟合,可能有人问,为什么不直接选择FitLiner呢?因为只有选FitPolynomial,才能在图形上显示公式,也就是勾选对话框中的ShowFlormulaongraph。(可能Origin的设计者认为线性拟合公式太简单,默认就不用显示了)
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5.点击OK后,就得到了拟合后的图形。线性方程公式也显示在了图形上。注意窗口的右下角。
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点击那里的小箭头后,我们可以看到完整的拟合统计信息,如相关系数R2=0.9918
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6.好了,标准曲线知道了,现在就来计算IC50。根据IC50定义,该例子中就是Y取中值时,X对应的数值,这里Y的中值是0.6,那根据线性方程就可以自己算出来对应的X值。那如果不是线性方程,公式比较复杂手工计算就很麻烦了,所以还是用Origin中的功能吧。
点击Tools,LinearFit,如果不是线性拟合的,请选择其他拟合方式,如果是S形曲线的,则需要选择SigmoidalFit.
?
7.在弹出的对话框中,先点击Fit,然后在FindY处输入0.6,点击FindX按钮,得到的数值就是IC50了。同样的可以很方便的求得IC90,IC10,IC20…
?Origin7.5下载地址:
\o/self.aspx/software/Origin75.rar/self.aspx/software/Origin75.rar
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