临床基因诊断进展-陈鸣.pptVIP

全自动测序方法AutomatedSequencing测序技术的飞跃2003年，“HGP”获得首张人类全基因组图谱，花费了30亿美元和13年的时间CraigVenter开发出一种快速追踪测序方法，并于2007年9月完成Venter自身全基因组的测定工作，花费了大约1亿美元BadboyofScience测序技术的飞跃2008.4.17《Nature》杂志上，454测序新技术：美国454LifeSciences公司，花了150万美元，4个月IlluminagenomeanalyzerAppliedBiosystemsSOLiDsequencer*耳聋基因检测的价值耳聋父亲耳聋母亲子女正常携带者100%基因检测可指导聋人的婚配，避免婚后再生聋儿！针对聋人群体：*基因在NSHL中所占比例突变热点主要人群比例GJB2~40%35delGCaucasoid50-70%176del16Asiannodata235delGChinese80%299delATAsiannodataGJB3nodata538CTChinesenodataPDS~40%IVS7-2AGChinese50%2168AGChinese10%Japanese50%12SrRNAnodata1555AGChinese7%1494CTChinesenodata现有位点可覆盖中国人群中98%GJB2,80%PDS,90%药物性耳聋患者遗传性耳聋检测试剂盒包括的基因位点晶芯?遗传性耳聋基因检测试剂盒标本采集3管EDTA抗凝的紫头管（最好空腹）*遗传性耳聋检测芯片的检测结果235杂合1555均质IVS杂合2168和IVS复合杂合2168纯合WildTypeControlWildtypeMutation可对四个基因9个位点的基因型进行准确检测，报告野生、杂合突变或纯合突变等三种结果QCBCPCPCNCQC35WIC35538W35MICG3538M176W1494WPC176M1494MBC235W1555W2168W235M1555M2168M299WICmtIVSW299MIC21IVSMICG2BCICIVS检测意义GJB2基因——先天性耳聋基因：当GJB2基因发生突变时，患者出生即表现出耳聋症状检测意义：为耳聋患者确诊病因；指导生育有聋儿的家庭再次生育；筛查有耳聋家族史的家庭成员的基因突变情况；等检测意义：通过检测此基因，可以明确被检者该基因突变情况，指导患者用药；明确患者家庭中该疾病的遗传性线粒体12srRNA基因——药毒性耳聋致病基因：当该基因发生突变时，患者听力正常，但当使用氨基糖甙类药物时，就会导致重度耳聋的发生*GJB3基因——后天性耳聋基因：当GJB3基因发生突变时，患者青少年时期听力正常，当发育至青壮年期间（20～30岁）时，听力逐渐下降，直至发生重度耳聋1检测意义：通过检测此基因，可以为听力下降的患者明确病因；指导生育有聋病患者的家庭再次生育；筛查有耳聋家族史的家庭成员的基因突变情况2SLC26A4（PDS）基因——大前庭导水管综合征致病基因：当PDS基因发生突变时，患者出生时耳蜗发生畸变，但不发生耳聋症状，当患者患感冒、头部受打击时，听力逐渐下降，直至发生重度耳聋检测意义：通过检测此基因，可以为听力下降的患者明确病因；指导患者生活习惯，指导生育有聋病患者的家庭再次生育；筛查有耳聋家族史的家庭成员的基因突变情况*实例介绍1样本由杭州惠耳听力提供父亲：2168突变携带者；听力正常母亲：IVS突变携带者；听力正常孩子：SLC26A4基因复合杂合；聋儿*实例介绍2样本由中国聋康中心提供父亲：235突变携带者；听力正常母亲：299突变携带者；听力正常孩子：GJB2基因复合杂合；聋儿*实例介绍3父亲：野生型；聋儿母亲：野生型；聋儿孩子：野生型；听力正常样本由大坪医院提供液态芯片是基于Luminex200TM（美国Luminex公司）的是一个多功能生物芯片平台，既能检测蛋白、又能检测核酸的高通量技术平台通常用于免疫分析、核酸分析、受体和配体分