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第一章mRNA纯化及片段化(PurifythemRNAandFragmentation)3
第二章c第一链合成(SynthesizetheFirstStrandc)5
第三章c第二链合成(SynthesizetheSecondStrandc)6
第四章末端修复(PerformEndRepair)7
第五章3末端加腺苷酸(Adenylate3Ends)8
第六章连接接头(LigatetheAdapters)9
第七章富集纯化的c模板(EnrichthecTemplates)11
第八章文库质检(QCthelibraries)13
第九章簇生成(ClusterGeneration)14
第十章上机(Sequencing)15
第十一章试剂和仪器(ReagentandEquipment)16
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第一章mRNA纯化及片段化(PurifythemRNAand
Fragmentation)
1.实验前注意事项
A、建议使用6-10μg纯化前的totalRNA用于纯化mRNA。
B、磁珠纯化用的AMPureXPBeads需要提前放置室温平衡30min。
C、AMPureXPBeads纯化时,加入洗涤磁珠需在磁力架上进行,
勿打散磁珠。
D、磁珠纯化吸去上清液时,勿将磁珠带出。
E、AMPureXPBeads纯化时所需的80%EtOH现用现配。
2.在1.5mlRNase-free离心管中加入3g纯化后的总RNA。用RNase-free
水调节体积至50μL。
3.充分震荡混匀RNAPurificationBeads。
4.加入50μL已混匀的RNAPurificationBeads到含有RNA的1.5mlEP管
中。用移液器轻轻吹打数次,直到混匀为止。
5.65°C金属浴中孵育样品5min。
6.从金属浴中取出样品,室温放置5min。
7.将含有磁珠与RNA的1.5mlEP管放置在磁力架上,等待5min,使磁
珠与磁力架充分吸附。
8.待上清液澄清后,弃上清液,将含有mRNA-Beads的1.5mlEP管从磁
力架拿起,加入200μLBeadWashingBuffer,充分混匀。然后再放置在
磁力架上吸附,等待5min。
9.弃掉上清液,在加入50μLElutionBuffer,充分混匀。
10.混匀后,80°C金属浴中孵育样品2min,使mRNA从磁珠上洗脱。
11.待样品冷却至室温,再加入50μL的BeadBindingBuffer至含有
mRNA-Beads的1.5mL的EP管中,充分混匀后室温放置5min。
12.将重新结合的EP管放置在磁力架上吸附5min,使含有mRNA的磁珠
充分吸附到磁力架一边,与上清分离。
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13.待上清液澄清,弃上清液,将含有mRNA-Beads的EP管从磁力架
上取下,加入200μLBeadWashingBuffer,充分混匀,然后再放置
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