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边界顺序*I类内含子的剪接机制(四膜虫rRNA)Ⅱ类内含子的剪接(酵母mtRNA,真核mRNA前体)核mRNA的剪接****mRNADifferencesbetweenprokaryotesandeukaryotes:Prokaryotes原核mRNAtranscriptismature,anduseddirectlyfortranslationwithoutmodification.Sinceprokaryoteslackanucleus,mRNAalsoistranslatedonribosomesbeforeitistranscribedcompletely(i.e.,transcriptionandtranslationarecoupled).ProkaryotemRNAsarepolycistronic多顺反子,theycontainaminoacidcodinginformationformorethanonegene.Eukaryotes真核mRNAtranscriptisnotmature(pre-mRNA)andmustbemodifiedbyprocessing.Transcriptionandtranslationarenotcoupled.EukaryotemRNAsaremonocistronic单顺反子,theycontainaminoacidforjustonegene.*Transcriptionofprotein-codinggenesbyRNApolymeraseIIRecallthatRNApolymeraseIItranscribesmRNALikeprokaryotes,requiresapromoter,twotypesBasalelements(nearthetranscriptionstart,~-25bp) e.g.,“TATABox”=TATAAAA *AT-richDNAiseasiertodenaturethanGC-richDNAProximalelements(locatedupstream,~-50to-200bp) e.g.,“CatBox”=CAATand“GCBox”GGGCGG*起始子(initiator,Inr)mRNA的第一个碱基倾向A位于-3~+5提供RNApolⅡ识别。无论TATA是否存在,Inr对启动子的强度和起始位点的选择都是重要的。现已纯化了Inr结合蛋白。*核心元件TATA框合又称Hogness框,Goldberg-Hogness框,俚语称为金砖(Goldbrick)其一致序列是:T85A97T93A85A63A83a50常在-25左右,相当于原核的-10序列。其作用是:(1)选择正确的转录起始位点,保证精确起始,故也称为选择子(selector)。(2)影响转录的速率。*上游启动子元件上游调控区:真核Ⅱ型启动子上游具有多种调控元件:CAAT盒:转录起始位点上游70-80bp处的CAAT顺序。GC盒:位于CAAT盒邻近,共同顺序:GGGCGG。此外,在不同的启动子上还有其它类型的上游启动子元件,他们是转录调控因子结合的位点,影响着转录活化和频率。*远端调控:增强子增强启动子的转录活性。其特点是:①具有远距离效应。(-200bp)②无方向性。③顺式调节。④无物种和基因的特异性。⑤具有组织的特异性。⑥其作用和DNA的构象有关。*IntroductiontoRNAprocessing 1.5′capping 2.3′cleavageandpolyadenylation 3.RNAsplicing剪接(nuclearpre-mRNA)三、真核生物的转录后加工*EukaryoticmRNAprocessingoverview*Transcription–mRNAprocessingRelationshipbetweenGenesandProteins**5′capping5′endofpre-mRNAiscovalently共价modified7-methylgu
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