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如何使用Modin加速One-Hot编码
在处理分类变量时,单热编码充当机器学习管道中的预处理步骤。机器学习模型需要数值数据,这意味着我们需要将分类变量(如“红色”、“蓝色”、“绿色”)转换为它们可以处理的格式。虽然pandas使用pd.get_dummies()使这种转换变得简单,但对于大型数据集,操作可能会大大减慢。让我们探讨一下Modin如何在保持熟悉的pandas界面的同时加速one-hot编码。
One-Hot编码的计算挑战
要了解为什么one-hot编码会影响性能,请考虑将具有值“红色”、“蓝色”和“绿色”的简单颜色列转换为二进制列。对于每个独特的类别,我们创建一个新列并用零和一填充它。当您将其扩展到数百万行和多个分类列(每个分类列有数十个唯一值)时,计算要求会因以下几个原因而显着增长:
1.内存扩展:每个唯一的类别值都会创建一个新列。具有100个唯一值的分类变量会产生100个新列。对于多个分类变量,这种扩展会迅速成倍增加。
2.稀疏数据处理:生成的矩阵大部分包含零。在每一行中,只有一个新列包含1,而所有其他列都包含0。此模式需要特定的优化才能有效处理。
3.字符串比较:该过程涉及许多字符串比较来匹配类别,这比比较数字需要更多的计算时间。
4.列生成:创建和管理新列涉及协调数据结构和索引对齐,尤其是在同时处理多个分类变量时。
创建代表性数据集
我们将创建一个数据集,让我们能够大规模测试one-hot编码。使用scikit-learn的make_classification()函数为我们提供了一种生成具有已知特征的数据的受控方法:
?
从sklearn.datasets导入make_classification
将pandas导入为pd
将modin.pandas导入为mpd
导入时间
#创建具有分类特征的大型综合数据集
X,_=make_classification(n_samples=1000000,n_features=10,random_state=42)
类别=[A、B、C、D]
#将分类特征添加到DataFrame中
data=pd.DataFrame(X,columns=[fFeature_{i}foriinrange(10)])
数据[类别]=[类别[i%4]foriinrange(len(data))]
该数据集模拟了现实世界数据的常见特征:
–多个数值特征
–具有不同基数的分类变量
–挑战传统处理方法的规模
实施One-Hot编码基准
现在我们来比较一下pandas和Modin对于one-hot编码操作的性能:
?
defbenchmark_one_hot_encoding():
#熊猫计时
开始=时间.time()
pandas_encoded=pd.get_dummies(数据,columns=[类别])
pandas_time=time.time()-开始
#莫丁计时
开始=时间.time()
modin_data=mpd.DataFrame(数据)
modin_encoded=mpd.get_dummies(modin_data,columns=[类别])
modin_time=time.time()-开始
返回pandas_time、modin_time
print(对one-hot编码进行基准测试...)
pandas_time,modin_time=benchmark_one_hot_encoding()
print(fPandas时间:{pandas_time:.2f}秒)
print(fModin时间:{modin_time:.2f}秒)
print(f加速比:{pandas_time/modin_time:.2f}x)
结果显示了令人印象深刻的性能提升:
?
基准测试one-hot编码...
熊猫时间:0.20秒
莫丁时间:0.02秒
加速比:8.53x
Modin如何优化One-Hot编码
我们的基准测试显示速度提升了8.53倍-让我们看看Modin如何实现这一改进。与pandas在单个CPU核心上顺序处理数据不同,Modin使用了多种优化策略:
1.并行类别处理:考虑将数据集分成多个块,类似于向玩家发牌。每个CPU核心独立处理其部分。一个核心可能处理第1-1000行,另一个核心可能处理第1001-2000行,依此类推。这种方法效果很好,因为每个块都可以在不需要其他块的信息的情况下进行转换。
2.内存管理:Modin不是在内存中
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