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ICS65.020.20B04
DB12
天津市地方标准
DB12/T841—2018
转基因植物及其产品成分定量检测技术规范微流滴数字PCR法
Technicalguidelinesforquantitativedetectionofgeneticallymodifiedplantsandderivedproducts—DropletdigitalPCRmethod
2018-11-07发布2018-12-01实施
天津市市场和质量监督管理委员会发布
I
DB12/T841—2018
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准由天津市农村工作委员会提出并归口。
本标准起草单位:天津市农业质量标准与检测技术研究所、中国农业科学院生物技术研究所、天津市东丽区产品质量监督检验所。
本标准主要起草人:兰青阔、兰璞、李亮、赵新、沈晓玲、王成、宛煜嵩、陈锐、黄凤军、李文、李益歌。
1
DB12/T841—2018
转基因植物及其产品成分定量检测技术规范微流滴数字PCR法
1范围
本标准规定了转基因植物及其产品微流滴数字PCR检测方法的建立与确认的总体要求。本标准适用于转基因植物及其产品成分检测的微流滴数字PCR检测方法的建立与确认。
2术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
2.1
微流滴数字PCRdropletdigitalPCR
将DNA模板、引物/荧光探针、耐热DNA聚合酶及其缓冲液等PCR反应体系充分混匀后,通过乳化的方式分配至体积相同且相互物理隔离的油包水微流滴中。将形成的微流滴进行PCR扩增,对扩增后的微流滴进行荧光信号采集,通过阳性率和泊松分布计算获得样品中靶序列拷贝数或拷贝数浓度。
2.2
靶序列targetsequence
在PCR检测方法中,用作检测靶标的特异性DNA序列。
2.3
特异性specificity
实时荧光定量PCR的引物和探针对样品中靶标片段精准识别的能力。
2.4
定量限limitofquantification(LOQ)
在可接受的正确度和精密度水平上,样品中被定量检出的最低DNA模板含量或浓度。
2.5
正确度trueness
多次测试的均值与采纳的标准值之间的接近程度。
2.6
方法确认validationofmethod
通过提供明确的实验证据,证明所使用的检测方法能够充分满足测试目标的需求。
3实验室资质
进行转基因植物数字PCR检测方法制定的实验室,应满足以下要求:
——具备资质的转基因生物安全机构,从事过转基因植物成分定量测量工作,参加过权威部门组织的转基因植物定量测量能力验证或计量比对,并且测量结果在可控范围内;
——具备承担转基因生物安全检测工作所需的仪器设备和环境设施;
——转基因植物数字PCR检测方法研制人员应具备转基因生物安全检测工作相关业务知识。
2
DB12/T841—2018
4技术要求
4.1方法的建立
4.1.1检测引物和探针的设计与筛选
依据靶序列设计引物和探针,通过实验对其进行比较分析,筛选出适合的引物和探针组合,确保其对靶序列具有严格的特异性和符合要求的检测灵敏度。
4.1.2PCR反应体系和反应程序优化
通过试验确定适合的反应体系(模板量、引物、探针浓度等)及反应程序(退火温度、循环数等),能有效区分微反应体系的阳性信号和阴性信号。采用多重PCR检测方法的,应提供与单重PCR检测方法的对比结果。
4.1.3方法特异性测试
通过试验验证检测方法的特异性;特异性测试样品至少应包括三类:——含有靶序列的转基因植物材料;
——不含有靶序列的转基因植物材料;——不含靶序列的非转基因植物材料。
4.1.4方法灵敏度测试
依据技术平台,选择合理的靶序列拷贝数浓度测试范围,确定方法的线性动态范围和定量限。灵敏度测试浓度点数不少于5个,至少3次重复,每次试验至少设置3个平行。
4.1.5方法适用性测试
选择合适的加工品类型,测试方法的适用性。
4.2实验室内方法验证
4.2.1线性度
微流滴数字PCR方法的线性度以线性回归曲线的决定系数R2表示,均值应≥0.98。
4.2.2精密度
线性动态范围内的精密度用重复性相对标准偏差RSDr表示,应≤25%。
4.2.3正确度
在整个线性动态范围内,多次测试的均值与采纳的标准值之间的接近程度,且偏差不超过标准值的25%。
4.2.4定量限
线性动态范围内,符合精密度条件的最低拷贝数浓度。
4.2.5再现性
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