蛋白质结构-3ppt课件.pptxVIP

体外折叠研究：

如：变性和复性

体内折叠研究：

新生肽链折叠;一蛋白折叠的机制及途径:;（二）折叠中间态：

熔球态(moltenglobulestate):

①具有与天然肽一样的类似紧密程度

②二级结构形成，但三级结构未成形

③比天然肽具有更多的疏水表面

前熔球态(pro-moltenglobulestate):

比熔球态松散的结构形态称为“前熔球态”

用cytc为实验对象观察到在低离子强度下分子的紧密程度比熔球态弱，几乎所有在天然态中存在的螺旋区域仍停留于二级结构状态。这种结构形态即为前熔球态

;（三）蛋白质折叠的限速步骤：;二蛋白折叠及装配过程中的辅助因子

（一）分子伴侣(molecularchaperones)：

Ellis提出：把一类在细胞中帮助新生肽链正确折叠,而

本身不是最终功能蛋白分子的组成部分的蛋白

分子称为分子伴侣

进化上十分保守的蛋白，在真核及原核细胞中分布广

与酶不同:(1)对靶蛋白不具有高度专一性

(2)不具有高效性

(3)有时只是阻止肽链的错误折叠，

而不促进折叠;（3）Stress-70(Hsp70):

在所有物种中高度保守；单体Mr=70,000

所有成员都有一定的ATP酶活性，帮助从靶蛋白上释放

功能：

识别未折叠或错误折叠的蛋白并以单体形式与其结合，在ATP存在下，帮助正确折叠

此外，细胞质中的Hsp70能与核糖体上正在合成的新生肽链结合，使多肽以完全伸展的状态进行跨膜运输。

Stress-70家族成员：Dnak，DnaJ（E.coli）;

Bip（动物细胞内质网腔）；

Scs1P（酵母线粒体）;;(4)Stress-90：

功能不十分清楚，一般只与少数几种底物蛋白作用，如：几种蛋白激酶，钙调素等

(5)分子内伴侣:枯草杆菌的Ser蛋白酶（胞外酶）

N信号肽-----前导肽（77aa）------酶蛋白C;（三）分子伴侣的功能;（四）折叠酶（foldase）:

催化与蛋白折叠直接相关的、对形成功能构象所必须的共价键变化的酶

1PDI(proteindisulfideisomerase，蛋白???硫键异构酶)：

催化-s-s-反应的酶，位于细胞的内质网管腔中，Mr=58,000

PDI是一个最为突出的多功能蛋白:

①二硫键异构酶：巯基氧化、二硫键还原和二硫键交换

②四聚体Pro-4-羟化酶的(?2β2)的β亚基

（防止?亚基错误折叠)

③微粒体内甘油三脂转移蛋白复合物(二亚基)的小亚基

④一种糖基化位点结合蛋白⑤具有分子伴侣的功能;PDI结构：

为二聚体蛋白，每个单体有五个结构域

;核磁共振法（NMR）测定的PDI结构域a和结构域b;2.肽基脯氨酰顺反异构酶

(peptidylprolylcis-transisomerase,PPI):;在T细胞中：PPIase起抑制T淋巴细胞功能的生理作用。基本作用：是催化蛋白质折叠的起始过程及其Pro顺反异

构化的酶。

通过非共价键方式稳定扭曲的酰胺过渡态而催化肽酰基脯氨酰基（X-Pro）间的顺式与反式的相互转变。

例如，在碳酸酐酶的折叠中，PPIase一方面在其早期中间体的形成过程中起分子伴侣的作用（阻止不正确的凝聚），另一方面在折叠的较晚时期发挥以上催化活性

;三蛋白质折叠的研究方法及思路;（二）研究方法：;第九节蛋白质结构预测;2.根据氢键类型分类：

Kabsh和Sander等1983年提出

依据：若蛋白质骨架上第i个残基与第i+1个残基之间形成氢键，则定义为“n-回折”。

如果仅有一个n-回折，则定义为?-转角；

若