簇毛麦5VS基因组分析及其抗条锈病基因Yr5V遗传定位.pdfVIP

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摘要I

ABSTRACTIII

第一章文献综述1

1小麦及其近缘属种基因组研究1

1.1普通小麦的进化和遗传改良1

1.2麦类作物基因组研究3

2小麦条锈病4

2.1小麦条锈病的危害和防治4

2.2小麦条锈菌及其生理小种5

2.3小麦条锈病抗性基因发掘及利用5

2.4小麦已克隆的抗条锈病基因8

3小麦基因定位与克隆的技术研究11

3.1小麦基因定位克隆的策略11

3.2小麦基因克隆中常用分子标记14

4本研究的目的和意义16

5技术路线16

第二章簇毛麦5VS基因组分析19

1实验材料19

2实验方法19

2.15DL.5VS#45VS#519

和染色体的分拣测序

2.25VS的组装及注释20

2.35VS的比较基因组分析21

2.4SNPINDEL21

和变异挖掘

2.5基于片段相似度的比对21

3结果与分析22

3.1不同来源簇毛麦5VS的分拣测序及组装22

3.2簇毛麦5VS的基因和重复序列注释24

3.3基于簇毛麦5VS的比较基因组分析25

3.4簇毛麦5VS替换普通小麦5DS的基因组变异分析27

3.5不同来源簇毛麦5VS的基因组差异分析31

4讨论32

4.1染色体分拣测序在小麦基因定位中的应用32

4.2簇毛麦5VS的引入丰富了普通小麦遗传多样性32

第三章簇毛麦5VS上抗条锈病基因Yr5V的遗传定位35

1实验材料35

2实验方法35

2.1条锈病接种与鉴定35

2.2分子标记的开发37

i

簇毛麦5VS基因组分析及其抗条锈病基因Yr5V遗传定位

2.3小麦基因组DNA的提取38

2.4PCR扩增及聚丙烯酰胺凝胶电泳检测39

2.5遗传连锁图谱的构建40

2.6交换单株的筛选40

3结果与分析41

3.1两个T5DL.5VS易位系的条锈病抗性鉴定41

3.2TF5V-8-13的条锈病抗性遗传分析43

3.3Yr5V的遗传定位44

4讨论49

4.1成株期抗条锈病新基因Yr5V49

4.2小麦外源基因Yr5V的定位策略50

4.3小麦抗条锈病基因Yr5V的精细定位与克隆50

全文结论53

创新点及不足之处55

参