- 1、本文档共4页,可阅读全部内容。
- 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
百川东到海,何时复西归?少壮不努力,老大徒伤悲。——汉乐府
实验二利用Gaussian进行几何优化(寻找过渡态)
一、实验目的
1)了解势能面、极小值、极大值、鞍点、最小能量途径的意义;
2)利用Gaussview搭建分子模型,建立相Gaussian09输入文件;
3)依据所建模型体系大小选择合适方法、基组,进行结构优化;
4)掌握结构优化结果文件分析,并利用Gaussview分析计算结果;
5)分析几何优化过程中相关量的优化过程,寻找乙胺分子两个异构体的过渡
态。
二、实验原理以及方法
势能面:由于分子自身几何构型微小变化产生的能量变化而绘制的能量图。
势能面是连接几何构型和能量的数学对应关系曲线。
1)极大值:一个区域内的能量最高点,向任何方向的
几何变化都能够引起能量的减小。
2)全局最大值:在所有的局域极大值中的最大值,就
是全局最大值。(极小值也同样)
3)鞍点:在一个方向上具有极大值,而在其他方向上
具有极小值的点。(一般的,鞍点代表连接着两个极
小值的过渡态)
4)静态点:对于所有极小值和鞍点,其能量对位置的一
阶偏导数,即梯度(gradient)都为零,这样的点被称为静
图1势能面解析图态点(stationarypoint)
几何优化:就是在势能面上寻找寻找极小值点,极小值点对应的几何构型就
是分子可能的平衡几何构型。优化方法:由初始构型开始,计算能量和梯度,决
定下一步的方向和步长,其向能量下降最快的方向进行。当只有当计算收敛的时
候优化才会结束。
高斯默认的收敛标准:
(这四个条件必须同时满足,才可认为得到了稳定的几何构型)
1)力的最大值小于0.00045;
2)力的均方根小于0.0003;
3)于下一步计算的位移差小于0.0018;
4)位移差均方根小于0.0012。
三、实验仪器
百川东到海,何时复西归?少壮不努力,老大徒伤悲。——汉乐府
Gaussian09,GaussView,软件计算机
四、实验步骤
首先在GaussView中构建分子构型(乙胺的两个异构体),然后分别进行几
何优化,优化至能量最低值minimum,使用优化后的分子,分别使用两种方法
寻找其过渡态TS,对两种方法计算的最终结果进行比较分析。
五、计算结果分析
1)计算所用的乙胺分子如图2所示。如图所示两个分子中-NH2的空间原子
排布相互垂直,认为这两种构型对应乙胺分子势能面中的两个极小值点的构型,
因此可以想象,过渡态所对应的分子构型应为-NH2在两种构型中间位置。
图2乙胺分子的两种同分异构体
2)软件判断收敛的标准
如下截图所示,当计算所得分子的能量和梯度值(Value)大于阈值(Threshold)
时,将返回重新计算,只有当能量和梯度均小于阈值时,循环才会停止,此时即
文档评论(0)