2025年行业调查全基因组测序（WGS）目前是否适合于临床应用？.pdfVIP

博观而约取，厚积而薄发。——苏轼

行业调查全基因组测序（WGS）目前是否适合于临床应用？

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近年来随着高通量测序技术的进一步发展，测序成本持续降低，

全外显子测序（whole-exomesequencing,WES）越来越多地被应

用于遗传病检测，提高了疾病的诊断率。那么，更大覆盖范围的全基

因组测序（whole-genomesequencing,WGS）目前是否适合于在

临床推广应用？

3月17日，在基因与医疗和健康论坛以发起辩论的方式开展调查，

截至4月1日，共有87人发表观点（详见后文），正方22人，反方

49人，中立16人。感谢大家的积极参与，群策群力，共同推动行业

有序发展。欢迎加入论坛！

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这个问题是国内外基因行业共同关注的焦点。3月22日Genet

Med.在线发表文章（PMID:），题目为Whole-genome

sequencingoffersadditionalbutlimitedclinicalutilitycompared

withreanalysisofwhole-exomesequencing.

之前很少有WGS和WES对于遗传病检出率的对比分析。经过筛

选，共有108例患者入组进行WGS分析，均为之前的基因芯片与

WES检测结果为阴性，而且临床资料和之前测序原始数据保存完整。

结果显示：10例（9%）WGS分析出阳性结果，5例结果不确定，93

例为阴性结果。

丹青不知老将至，贫贱于我如浮云。——杜甫

作者分析了10例WGS检出阳性结果的原因，包括3个方面：

（1）WES和WGS检测间隔时间：第1、2、3例虽然之前WES

也检测到了变异位点，但是没有报告为致病位点，主要是因为WES分

析时致病基因与临床表型的关系还没有确定；

（2）结构变异与非编码区变异的影响：第4、5、6例属于这种情

况；

（3）测序平台的影响：第7、8、9、10例属于这种情况，通过

Illumina平台WES均检测到变异位点。

综上所述，在10例之前WES检测为阴性的病例中，7例可通过

WES重分析和WGS检出，另外3例通过WGS检出结构变异和非编

码区变异。

让我们看一下国内相关专业人士的意见，包括临床医生、遗传分

析/咨询人员、生信分析人员等。各方具有不同的专业背景和工作场景，

站在不同的位置，视角和视野不同，加强交流很有必要。以下为意见

摘选，如果希望看到全部意见，可点击文末“阅读原文”。

正方：

1.对于临床不明原因的疾病,尤其是儿童发育落后，智力低下等。

在CMA,NGS,WES都不能诊断的情况下，个人觉得很有必要做WGS。

2.随着WGS的价格的下降，我认为对于挑战而言，更应该探寻怎

么利用好这个工具。由于WGS带来的均一性，一般认为30X覆盖已

经非常足够，可以参考这个pre-print：

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