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常用生物医学数据库与分析软件介绍
目录
一、生物医学数据库.........................................2
国内生物医学数据库......................................3
1.1中国生物医学文献数据库.................................4
1.2国家药物临床试验注册数据库.............................5
1.3中国疾病监测报告数据库.................................6
国外生物医学数据库......................................6
2.1PubMed数据库...........................................8
2.2Scopus数据库...........................................9
2.3WebofScience数据库..................................11
二、生物信息学分析软件....................................12
基因组学分析软件.......................................13
1.1DNA序列分析软件.......................................15
1.2RNA序列分析软件.......................................17
1.3基因表达数据分析软件..................................18
蛋白质组学分析软件.....................................20
2.1蛋白质序列分析软件....................................21
2.2蛋白质结构预测软件....................................23
2.3蛋白质相互作用分析软件................................24
三、数据分析与可视化工具..................................26
生物统计软件...........................................28
1.1SPSS统计软件介绍及应用案例............................29
1.2SAS统计软件介绍及应用案例.............................30
1.3STATA统计软件介绍及应用案例...........................32
数据可视化工具软件介绍及应用案例.......................33
四、数据库与分析软件的联合应用案例解析....................35
一、生物医学数据库
生物医学数据库是生物医学领域研究人员不可或缺的工具,它们提供了大量的生物医学信息资源,包括基因序列、蛋白质结构、生物标志物、疾病模型、临床试验数据等。以下是一些常用的生物医学数据库及其特点:
GenBank
描述:由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的公共数据库,包含了大量的核酸和蛋白质序列数据。
特点:是全球最大的基因序列数据库,数据更新迅速,提供了丰富的序列比对、同源有哪些信誉好的足球投注网站和分析工具。
UniProt
描述:收集了蛋白质序列和功能信息,是国际上最大的蛋白质数据库。
特点:提供了蛋白质序列、结构、功能、变异和注释等详细信息,支持多种语言访问。
PubMed
描述:由美国国立卫生研究院(NIH)资助,收录了超过3000万篇生物医学文献,是科研人员查找文献的重要资源。
特点:检索功能强大,支持关键词有哪些信誉好的足球投注网站、高级有哪些信誉好的足球投注网站和文献筛选等功能。
EMBL-EBI(EuropeanMolecularBiologyLaboratory-EuropeanBioinformaticsInstitute)
描述:位于英国剑桥的EMBL-EBI是一个国际性的生物信息学研究中心,提供了多种生物信息数据库和工具。
特点:包括序列数据库、结构数据库、功能注释数据库等,为科研人员提供全面的数据资源。
GEO(GeneExpressionOmnibus)
描述:由NCBI维护的基因表达数据库,存储了大量的基因表达数据。
特点:支持用户上传和分析基因表达数据,是研究基因表达模式的重要资源。
CancerGenomeAtlas(TCGA)
描述:美国国家癌症研究所(NCI)和NCBI合作的项目,
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