《分子标记SSR标记》课件.pptVIP

*******************分子标记SSR标记分子标记技术是一种基于DNA序列多态性的基因组分析方法。其中SSR标记是重要的遗传标记之一，具有广泛应用于物种鉴定、基因定位和标记分子辅助育种等领域。课程目标了解分子标记及其特点掌握SSR标记的定义、优势和应用领域。学习SSR标记的基本原理熟悉SSR标记的制备流程，从DNA提取到数据分析。掌握SSR标记的分析应用了解SSR标记在遗传图谱构建、品种鉴定和育种中的应用。什么是分子标记定义分子标记是基于DNA序列差异而产生的可检测的标记,用于标识和追踪特定的遗传特征。识别方法分子标记利用PCR扩增、限制性酶切、DNA杂交等方法,对DNA进行检测和分析。应用价值分子标记技术在遗传分析、品种鉴定、遗传改良等领域广泛应用,提高了育种效率。分子标记的特点高度多态性分子标记能在基因组上检测到大量的遗传多态性,为遗传分析提供丰富的信息。可重复性强分子标记技术能产生可重复的结果,为不同实验室间的数据对比和共享奠定基础。检测效率高分子标记技术能快速高效地筛选出遗传变异,为育种和遗传研究带来效率提升。检测准确性强分子标记能直接检测基因型,结果客观准确,不受环境及生长阶段的影响。SSR标记的定义简单序列重复（SSR）标记也称为微卫星标记,是一种基于核酸序列多态性的分子标记。它由1-6个核苷酸短串联重复单元构成,广泛分布于真核生物基因组中。高度多态性SSR标记在不同个体或品种之间,由于重复单元数量的差异,表现出较高的多态性,是一种强大的遗传标记。SSR标记的优势1多态性丰富SSR标记在基因组中分布广泛,多态性高,可以检测到大量遗传变异。2检测简单可靠SSR标记的检测技术成熟,操作简单,可重复性强,结果准确可靠。3基因组覆盖广SSR标记遍布整个基因组,可以提供全基因组范围内的遗传信息。4易于自动化SSR标记的检测可以通过自动化设备完成,提高了效率和准确性。SSR标记的应用遗传连锁分析SSR标记可用于构建高密度遗传连锁图谱,有助于定位有价值的基因和性状。品种鉴定和保护SSR标记可用于识别和鉴定品种,有助于保护优秀的种质资源。品质改良和育种SSR标记可作为分子标记协助进行品质和产量的改良,提高育种效率。SSR标记的基本原理1DNA序列SSR标记基于DNA序列中的简单重复序列2PCR扩增设计特异性引物,通过PCR从基因组DNA中扩增SSR序列3电泳检测SSR扩增产物电泳分离,检测SSR片段长度多态性SSR(SimpleSequenceRepeat)标记是基于基因组DNA中丰富存在的简单重复序列而发展起来的一种分子标记技术。通过对SSR序列特异性引物设计、PCR扩增和电泳分离,可以检测出不同基因型之间SSR序列长度的多态性,从而实现基因型鉴定和遗传分析。SSR分子标记的制备基因组DNA提取从目标样品中提取高质量的基因组DNA，为后续实验奠定基础。引物设计根据SSR序列特点设计合适的引物，确保增幅效率和特异性。PCR扩增利用设计好的引物进行PCR反应，扩增目标SSR片段。电泳分离采用高分辨率电泳技术分离PCR产物，检测目标条带。回收纯化从电泳凝胶上切割回收目标SSR片段，备用于后续克隆测序。基因组DNA的提取DNA提取是分子标记技术的关键步骤,可从各种生物样品中分离出高纯度的基因组DNA,为后续的PCR扩增和分析奠定基础。1取样从目标样品收集适量组织或细胞2破碎机械或酶解方式破坏细胞壁和膜3溶解利用缓冲液溶解DNA并去除杂质4分离通过离心、柱层析等方式纯化DNA5定量测定DNA浓度与纯度,确保质量引物设计与PCR扩增1引物设计根据目标SSR序列设计特异性引物，考虑引物长度、熔点温度、GC含量等因素，确保引物能够特异性地识别并扩增目标序列。2PCR扩增采用PCR技术对目标SSR序列进行扩增，通过优化PCR反应体系和条件,如引物浓度、退火温度、循环次数等,确保扩增产物质量和数量。3产物鉴定对PCR扩增产物进行电泳分析,检查扩增结果是否符合预期,如有多条目标条带需要进一步纯化回收。电泳分离与目标条带回收1电泳分离将提取的DNA样品加入到琼脂糖凝胶中进行电泳分离,根据DNA片段大小将其分层展示。2目标条带可视化通过柴油绿或溴化乙锭等DNA染料将分离的DNA条带染色,在紫外灯下观察并标记目标条带。3目标条带回收使用刀片或吸管小心地切割并回收目标DN