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10种WGBS数据比对策略在哺乳动物中的应用效果研究.pdf

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摘要

全基因组亚硫酸氢盐测序(Whole-genomebisulfitesequencing,WGBS)被广泛应

用于DNA甲基化图谱的研究,但样本DNA在WGBS建库过程中经过亚硫酸氢盐的

处理和聚合酶链式反应的扩增后,其DNA序列上未发生甲基化的胞嘧啶转化为胸腺

嘧啶,导致WGBS数据分析更复杂。尽管前人已经开发了很多软件处理WGBS数据,

但不同策略在数据比对及下游分析中的性能差异较大,尚无在多种哺乳动物中系统评

估和比较不同策略的研究。

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