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基于基因组学的乳酸杆菌色氨酸代谢特异性
目录
基于基因组学的乳酸杆菌色氨酸代谢特异性（1）．．．．．．．．．．．．．．．．4
内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1色氨酸代谢概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2乳酸杆菌在色氨酸代谢中的地位．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
基因组学基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1基因组测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2基因组注释与功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
2.3数据分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
乳酸杆菌基因组中色氨酸代谢相关基因．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.1色氨酸合成途径基因．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.2色氨酸分解途径基因．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
3.3色氨酸转运相关基因．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
色氨酸代谢途径的调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.1激素调控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.2环境因素调控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.3基因表达调控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
乳酸杆菌色氨酸代谢的特异性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
5.1代谢产物分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
5.2代谢途径酶活性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
5.3代谢途径基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
特异性乳酸杆菌在色氨酸代谢中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
6.1色氨酸生物合成．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
6.2色氨酸生物转化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
6.3色氨酸生物降解．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
实验研究方法与结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
7.1样本采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
7.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
7.3实验结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
讨论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
8.1研究结果讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
8.2存在的问题与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
8.3未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
基于基因组学的乳酸杆菌色氨酸代谢特异性（2）．．．．．．．．．．．．．．．39
内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
1.3研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
乳酸杆菌概述
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