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还原性脱卤酶的生物信息学分析
目录
还原性脱卤酶的生物信息学分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1还原性脱卤酶概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2生物信息学分析在还原性脱卤酶研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3文档目的与结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
还原性脱卤酶的序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1序列获取与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2序列比对与同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.3蛋白质结构预测与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
还原性脱卤酶的功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.1蛋白质功能位点预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.2酶活性位点分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
3.3酶催化机制研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
还原性脱卤酶的进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
4.1系统发育树构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.2进化速率分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.3进化模式探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
还原性脱卤酶的相互作用网络分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
5.1蛋白质互作网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
5.2互作网络拓扑结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
5.3关键互作蛋白识别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
还原性脱卤酶的基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
6.1基因表达数据获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
6.2基因表达水平分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
6.3基因表达调控网络研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
还原性脱卤酶的药物靶点预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
7.1药物靶点筛选方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
7.2药物靶点预测结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
7.3药物设计与应用前景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
总结与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
8.1研究成果总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
8.2存在问题与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
8.3未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
还原性脱卤酶的生物信息学分析（2）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
1.1还原性脱卤酶概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
1.2研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
二、文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
2.1相关研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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