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Nocardiopsis sp.HM-01的抑菌活性分析及抑菌物质初步探究.pdf

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摘要

海洋微生物在食品、医药、工业、农业等方面的应用越来越广泛,被认为是产生

新型生物活性物质的重要资源库。本课题针对前期从海水中分离出来的一株放线菌,

进行了形态学及16SrDNA鉴定,并将其命名为Nocardiopsissp.HM-01。随后对该菌

株的生长特征及抑菌特性进行研究,并对其亲缘关系较近的菌株构建泛基因组,评估

了该物种种群的代谢特征并对其次级代谢产物基因簇进行预测,推断潜在的抑菌物质。

最后结合超高效液相色谱-质谱联用技术对抑菌代谢物进行了鉴定,提出了

Nocardiopsissp.HM-01抑菌作用机制。

116SrDNA

()通过对菌株微观形态下的孢子、菌丝形态的观察及序列比对,该

NocardiopsisNocardiopsissp.HM-01

菌株被鉴定为拟诺卡氏菌属(),并将其命名为。

随后选取6种固体平板培养基进行了考察,并确定了菌株生长良好的培养基:RP培

养基和ISP培养基。之后对该菌株进行了高盐耐受测试,发现该菌株可在高达8%NaCl

的盐浓度下生存。

2Nocardiopsissp.HM-01

()考察了不同液态发酵时间下乙酸乙酯提取物对细菌

的抑制效果,结果显示,随着培养时间的增加,其对细菌的抑菌作用也逐渐增强,抑

9

菌效果在第天时达到最高,之后有下降趋势,但仍维持较高的抑菌效果;且对革兰

氏阳性菌(金黄色葡萄球菌)的抑制效果较革兰氏阴性菌(大肠杆菌)更为显著。

(3)在抑菌谱测定中,本研究发现,乙酸乙酯萃取的发酵液提取物对大肠杆菌、

金黄色葡萄球菌、鳗弧菌、鹰钩肠杆菌及铜绿假单胞菌具有强烈的抑制效应,而发酵

液无法对细菌产生抑制作用;同时,发酵液本身对木霉菌、灰霉菌等均有显著的抑制

活性,但乙酸乙酯萃取物对真菌却无法达到抑制效果。

4Nocardiopsissp.HM-0119

()通过对亲缘性较高的个基因组(平均核酸同一

性94%)进行了分析,评估了该物种潜在的营养代谢特征。泛基因组分析结果显示,

该物种具有从外界获得新的基因的开放性特征,能够为物种提供丰富的遗传资源库;

同时具备较保守的核心基因组,其中包含丰富的碳水化合物活性酶类以及β-内酰胺酶

类耐药性基因。

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()对上述拟诺卡氏菌基因组序列进行了次级代谢产物基因簇预测,推断出

个潜在的抑菌物质基因簇,进一步采用超高效液相色谱质谱联用仪对-Nocardiopsissp.

HM-01的发酵液及乙酸乙酯粗提物进行检测分析,鉴定出主要的抑菌活性物质为:

desferrioxamineE和icosalideB。

总之,本研究通过对海洋放线菌Nocardiopsissp.HM-01的形态学、抑菌效应、

抑菌谱的考察,初步揭示了该物种在抑制微生物,尤其是抑制原核微生物方面的潜在

价值,并通过基因组学挖掘技术,评估了该物种的基础代谢特征,并结合质谱技术对

抑菌化合物进行了验证,本文的发现将为该菌株在抑菌领域的应用奠定基础。

关键词:拟诺卡氏菌;泛基因组;次级代谢产物基因簇;抑菌谱;超高液相色谱

-质谱

ABSTRACT

Marinemicroorganismsareincreasinglybeingusedinfood,medicine,industry,

agricultureandareconsideredimport

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