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#源代码#SVM算法结合矩阵实现方法
Peaker
在处理高通量数据的过程中,我们经常需要借助各种分类模型实
现对数据的分类预测,对于预测结果我们有一些打分或评价方法来评
估模型的预测效能和稳定性等。其中一个最简单的方法就是预测精度,
通过Python的sklearn库可以调用专门用于计算预测精度的得分,可
以通过如下语句调用函数
fromsklearn.metricsimportaccuracy_score
然后我们对模型进行预测,获得两个集合,分别是y_true,y_pred,代表
的是预测集的真是和预测,然后根据这两个列表计算精度,
score=accuracy_score(y_true,y_pred),score即为预测出的精度。
然而利用accuracy_score函数评价模型的预测精度有时候略显简
单,因为我们无法详细的知道各个类别组分的样本具体的预测情
况,例些模型往往对于某一类的样本预测效果较好,而对于另一
类样本预测效果一般,通过accuracy_score难以评价这一情况。这时候
就可以利用confusionmatrix矩阵来进行分析。
矩阵是一种可以直观的比较predictedlabel和observedlabel
的矩阵形式,行和列分别代表不同label样本,通过比较predicted和
observedlabel,就可以直观的看出模型对于每一类的样本所预测的精
度结果。具体的实现方法如下
第一步:导入测试数据
数据格式为矩阵形式,横轴为label,纵轴为feature,如下所示
第二步:构建分类模型
我们采用SVM分类器,利用linear线性核函数进行分类,注意一点,
这里采用shuffle函数对样本进行随机化处理,对样本重新排序,然后
在构建分类器,代码如下
第三步:LOO交叉验证
利用留一法LeaveOneOut(LOO)分割样本,每次取一个样本为测试集,
其他的样本为训练集。对于每次循环够构建一次分类器,然后对于一
个样本进行预测,方法如下
第四步:计算confusionmatrix
这里我们已经利用SVM分类器通过LOO法对所有样本进行预测,接下
来我们通过confusionmatrix对数据进行整理分析,代码如下
我们通过printclassification_report(y_true,y_pred,
target_names=target_names)语句输出report结果。
代码输出结果如下所示
第五步:confusionmatrix可视化
最后矩阵进行可视化分析,使得用户可以更直观的看出每
个分类的预测精度高低。
输出结果如下所示
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