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红凤菜叶绿体全基因组特征及其序列比较分析
目录
红凤菜叶绿体全基因组特征及其序列比较分析（1）．．．．．．．．．．．．．．4
内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
红凤菜叶绿体基因组研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1叶绿体基因组结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2叶绿体基因组研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.3红凤菜叶绿体基因组研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
红凤菜叶绿体全基因组序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.1序列获取与组装．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.2序列质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.3基因结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
红凤菜叶绿体全基因组特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
4.1基因家族分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.1.1同源基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.1.2基因家族进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
4.2基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
4.2.1基因表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
4.2.2基因表达调控分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
4.3基因突变分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
4.3.1突变频率分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
4.3.2突变类型分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
红凤菜叶绿体全基因组序列比较分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
5.1与其他植物叶绿体基因组比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
5.1.1同源基因比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
5.1.2基因家族比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
5.2与拟南芥叶绿体基因组比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
5.2.1基因结构比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
5.2.2基因表达比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
5.3与其他物种叶绿体基因组比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
5.3.1跨物种比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
5.3.2叶绿体基因组进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
结果与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
6.1红凤菜叶绿体基因组特征总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
6.2序列比较分析结果解读．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
6.3研究结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
红凤菜叶绿体全基因组特征及其序列比较分析（2）．．．．．．．．．．．．．44
一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．
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