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核酸Nucleicaciddetectiontechnology核酸检测技术第二节转录与逆转录
成熟的RNA分子DNA转录RNA前体加工DNA指导下RNA的合成RNA的转录后加工
一、转录(DNA指导下RNA的合成)(一)概念转录:DNA指导下RNA的合成。以DNA为摸板,4种核糖核苷酸(NTP)为底物,在RNA聚合酶的作用下,按照碱基互补规律,合成RNA链的过程。
转录的不对称性与转录出的RNA顺序相同的一条链(仅T代替U)编码链(codingstrand,+链)转录时,DNA双链不是同时作为模板,而是在一定条件下,只有一条链(或其上某些区域)可作为转录的模板。为RNA提供转录模板的链。模板链(templatestrand,-链)
编码链(正链)模板链(负链)编码链(正链)模板链(负链)
不是所有基因的编码链都位于DNA分子的同一条链上。ABCD编码链基因的转录是有选择性的。-并不是全部DNA都必须转录-根据细胞实际需求,特定的基因“开放”或“关闭”,具复杂的调控机制。
一、转录(DNA指导下RNA的合成)RNA的转录起始于DNA模板的一个特定位点,并在另一位点处终止,此转录区域称为转录单位。真核生物例:mRNA编码的转录单位原核生物转录单位(单顺反子)(1个基因)转录mRNA1种蛋白质翻译转录单位(多顺反子)(多个基因)转录mRNA多种蛋白质翻译(二)转录单位
一、转录(DNA指导下RNA的合成)(三)RNA聚合酶:大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基α2ββσ组成,五个亚基的功能分别为:α亚基:具体功能不详。β亚基:含催化部位,起催化作用,催化形成磷酸二酯键。β’亚基:与DNA模板结合功能。σ亚基:识别起始位点。
大肠杆菌RNA聚合酶全酶示意图
真核细胞的RNA聚合酶酶类分布产物α-鹅膏蕈碱对酶的作用I核仁rRNA5.8SrRNA18SrRNA28SrRNA不抑制Ⅱ核质mRNAtRNA低浓度抑制Ⅲ核质5SrRNA高浓度抑制
一、转录(DNA指导下RNA的合成)RNA聚合酶的特点1、反应底物:NTP,DNA为模板、Mg2+促进聚合反应。RNA聚合酶不需要引物,合成方向5??3?。2、利福平抑制原核生物RNA聚合酶活性;α-鹅膏蕈碱抑制真核生物RNA聚合酶活性。
一、转录(DNA指导下RNA的合成)(四)、RNA的转录过程:(以大肠杆菌为例)转录起始链的延伸转录终止
RNA的合成不需要引物。1.转录起始指RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列。启动子-35序列提供了RNA聚合酶全酶识别的信号;-10序列是酶的紧密结合位点(富含AT碱基,利于双链打开);第三部分是RNA合成的起始点。启动子的结构至少由三部分组成AACTGTATATTATTGACATATAAT+1转录起始点5’3’3’5’-35序列提供RNA聚合酶全酶识别信号-10序列双链解开区域
DNA序列的书写方式(编码链)+15?3?转录起点上游upstream下游downstream转录单位的起点核苷酸定为+1,起点的左侧为上游,用负的数码表示,起点的右侧为下游,即转录区。
RNA聚合酶全酶扫描解链区,找到起始点,然后结合第一个核苷三磷酸。加入的第一个核苷三磷酸常是GTP或ATP,很少是CTP,不用UTP。所形成的启动子、全酶和核苷三磷酸复合物称为三元起始复合物,第一个核苷三磷酸一旦掺入到转录起始点,σ亚基就会被释放脱离核心酶。?E-35-10pppG或pppA5‘5‘3‘3‘模板链?因子仅与起始有关,RNA的合成一旦开始,便被释放
2.RNA链的延伸
DNA分子和酶分子发生构象的变化,核心酶与DNA结合比较松弛,可沿DNA模板移动,并按模板顺序选择下一个核苷酸,将核苷三磷酸加到生长的RNA链的3’-OH端,催化形成磷酸二酯键。转录延伸方向从5’?3’
在DNA分子上(基因末端)提供转录停止信号的DNA序列称为终止子(terminators),它能使RNA聚合酶停止合成RNA并释放出RNA。3.转录终止
原核生物中RNA的转录过程模板的识别转录的起始转录的延伸转录的终止3?5?3?5?3?5?
一、转录(DNA指导下RNA的合成)(五)、真核生物的转录作用真核生物的转录与原核生物转录比较,主要区别:RNA聚合酶不同启动子不同转录后RNA加工修饰不同
一、转录(DNA指导下RNA的合成)(六)、RNA的转录后加工在细胞内,由RNA聚合酶合成的原初转录物(primarytranscript)往往需要一系列的变化,包括链的裂解、5?和3?末端的切除和特殊结构的形成、核苷的修饰、以及拼接和编辑等过程,才转变为成熟的RNA分子。此过程总称为RNA的成熟或称为RNA的转录后加工。
原核生物的m
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