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DB36/XXXXX—XXXX
山药种薯(苗)病毒RT-PCR检测技术规程
1范围
本标准规定了山药种薯(苗)病毒RT-PCR检测技术的术语和定义、检测对象、抽样、RT-PCR检测方法、种薯(苗)质量标准等。
本标准适用于山药种薯(块茎、零余子)、种苗病毒的定性检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
NY/T402脱毒甘薯种薯(苗)病毒检测技术规程
NY/T1212马铃薯脱毒种薯繁育技术规程SN/T2964植物病毒检测规范
SN/T3457植物病毒分子生物学检测规范
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术语和定义
下列术语和定义适用于本标准。3.1
反转录PCRReversetranscriptionPCR
指一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。3.2
带毒率Virus-carryingrate
指各级别山药种薯(苗)受病毒侵染薯块(植株)比率。
4检测对象
中国淮山药坏死花叶病毒(Chineseyamnecrosismosaicvirus,简称CHYNMV)日本淮山药花叶病毒(Japaneseyammosaicvirus,简称JYMV)
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山药温和花叶病毒(Yammildmosaicvirus,简称YMMV)马铃薯M病毒(PotatovirusM,简称PVM)
菜豆萎焉病毒(Beanwiltvirus,简称BBWV
5抽样
5.1脱毒组培苗抽样
每个茎尖分生组织培养系均应检测。
5.2田间抽样
5.2.1原原种田和原种田抽样
甩蔓期、开花期、收获前2w,采用五点法取样,抽样标准见表1。每株取茎蔓上、中、下部叶片1g~5g。将第一次抽取的样品混合后,原原种抽取20%以上(含)样品进行检测。原种抽取10%以上(含)的样品进行检测。
表1抽样数量标准表
田块面积(hm2)
抽样量
抽样最低量(株)
面积≤0.1
40株/点
200
0.1hm2<面积≤1hm2
100株/点
—
面积>1hm2
按0.1hm2<面积≤1hm2划区,500株/区
—
5.2.2生产用种田抽样
开花期及收获前2w,取样检测。抽样标准见表2。每株取茎蔓上、中、下部叶片1g~5g。将第一次抽取的样品混合后,抽取5%以上(含)样品进行检测。
表2抽样数量标准表
种薯(苗)总量,株
抽样百分率,%
抽样最低数量,株
≤10000
6~10
100
10000
3~5
—
5.3没有经过田间检测的种薯、零余子、种苗检测
抽样数量标准见表3。将第一次抽取的样品混合后,进行二次抽样,随机抽取5%以上(含)的样品检测。
表3抽样数量标准表
种类
种薯(苗)总量
抽样百分率,%
抽样最低数量
种薯
≤10000kg
6~10
100kg
10000kg
3~5
—
零余子
≤100kg
3~5
1kg
100kg
1~2
—
种苗
≤10000株
6~10
100株
10000株
3~5
—
注:不足抽样最低数量的全部作为混合样品。
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6RT-PCR检测方法
6.1样品处理
取样叶片、块茎、零余子等组织100mg,置于研钵中,加液氮研磨至粉末状。
6.2总RNA提取
用植物RNA提取试剂盒提取样品的总RNA,具体提取步骤按照相应说明书进行。
6.3TR-PCR
以实验室保存的标准CHYNMV、JYMV、YMMV、PVM和BBWV病毒总RNA为阳性对照,以健康山药叶片或块茎或零余子总RNA为阴性对照,采用特异性引物对待测样品进行检测,具体引物序列见附件B。扩增过程按照RT-PCR一步法试剂盒说明书操作,反应在50μL体系中进行,各组分如下:2×1StepBuffer25μL、PrimeScript1StepEnzymeMix2μL、上下游各1μL、TotalRNA模板1μL,加RNaseFreeddH2O至50μL。扩增程序:50℃反应30min;94℃预变性2min;94℃变性30s,53~60℃退火30s(病毒引物对应的退火温度见附件B),72℃延伸1min,30个循环;72℃延伸10min。
6.4PCR产物电泳检测
取扩增样品5μL,加入1
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