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蛋白质设计中的口袋预测与计算优化新方法

一、引言

蛋白质作为生命活动中不可或缺的生物大分子，其结构和功能的研究一直是生物科学领域的热点。其中，蛋白质的口袋结构作为其功能的关键部分，对于理解蛋白质与小分子配体的相互作用、酶的催化机制等具有重大意义。然而，蛋白质口袋的预测及计算优化一直存在挑战。本文旨在介绍一种新的蛋白质口袋预测与计算优化方法，以解决当前面临的问题。

二、蛋白质口袋的概述

蛋白质口袋是指蛋白质分子表面凹陷的区域，通常具有特定的形状和化学性质，能够与小分子配体结合。蛋白质口袋的结构和性质对于酶的活性、信号传导、分子识别等生物过程具有重要意义。因此，对蛋白质口袋的准确预测和优化对于理解